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À l'heure où les projets de séquençage des génomes de divers organismes, dans leur phase actuelle, portent essentiellement sur les cartographies génétique et physique du génome étudié, l'objectif des approches biologiques et mathématiques est de rendre cette cartographie plus rapide, plus précise et plus fiable. Nous nous intéresserons dans ce paragraphe aux systèmes à base de contraintes utilisés dans le domaine de la cartographie physique et génétique.
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