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Nous venons de parcourir rapidement et certainement de manière non
exhaustive un certain nombre de cas réels posés dans le cadre de la biologie
moléculaire et de la génétique et ayant donné lieu à un traitement par
satisfaction de contraintes.
Pour beaucoup d'entre eux, ces problèmes sont théoriquement difficiles (
NP-complets). Cependant, l'origine même de ces problèmes modifie la façon
de les aborder :
- l'existence de quelques objets d'études précis (ADN, ARN, protéines),
dont de larges échantillons sont maintenant disponibles, donne à des études
de complexité en moyenne un caractère plus pertinent que pour des problèmes
NP-complets pouvant apparaître dans des contextes très variés ;
- l'apparition de nouvelles techniques biologiques peut totalement
modifier l'approche informatique d'un problème : des instances de problème
difficiles peuvent devenir des instances de problèmes faciles après
l'introduction de contraintes supplémentaires, issues de nouvelles
techniques. La coopération avec des biologistes semble indispensable pour
garantir la pertinence des travaux.
Tous ces problèmes semblent présenter des
caractéristiques communes, plus ou moins bien traitées par le cadre
CSP. Nous nous proposons de détailler ces caractéristiques selon deux
dimensions : nature des données et nature des requêtes.
Auteurs:Christine Gaspin, Christian Bessiere, Annick Moisan et Thomas Schiex
Dernière mise à jour: jeudi, 11 janvier 1996, 18:28:04 MET
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