These

Analyse des graphes de pangénome

Encadrants de thèse : Claire Lemaitre (Inria, Genscale), Thomas Farault (INRAE, GenPhySE), Matthias Zytnicki
Début de thèse : 01 octobre 2023
École doctorale : ED601 MATISSE
Établissement : Université de Rennes-I
Financement : PEPR Agroécologie & Numérique

Siegfried Dubois

01 oct. 2023

These SaAB

Intégration de données multi-omiques appariées à grande échelle

Directrices de thèse : Nathalie Vialaneix (INRAE, MIAT), Andrea Rau (INRAE, GABI)
École doctorale : MITT
Jusqu’à septembre 2024
Établissement : INSA Toulouse
Financement : 100% PEPR Agroécologie et numérique - AgroDiv

Jeong Hwan Ko

01 oct. 2023

These SaAB

Transfert d'annotations génomiques par graphes de pangénomes

Encadrants de thèse : François Sabot (IRD, PANIC), Matthias Zytnicki
Début de thèse : 01 octobre 2023
École doctorale : ED584 GAIA
Établissement : Université de Montpellier
Financement : PEPR Agroécologie & Numérique

Nina Marthe

01 oct. 2023

These SaAB

Empreintes génomiques de la sélection et effet de la variation génétique sur les phénotypes de deux espèces d’arbres forestier (le chêne sessile) et fruitiers (l’abricotier) : focus sur les variants structuraux

Encadrants de thèse : Véronique Decroocq (INRAE, BFP), Benjamin Linard (INRAE, MIAT)
Début de thèse : 14 septembre 2023
École doctorale : ED154 SVS
Établissement : Université de Bordeaux
Financement : Bourse ministèreille, MESR

Ismaël Blanchard

14 sept. 2023

These SaAB

Apprentissage statistique pour l'identification d'OTUs et la caractérisation de la biodiversité.

Directeurs de thèse : Alain Franc (INRA BioGeCo), Olivier Coulaud (INRIA Hiepacs), Nathalie Peyrard
Soutenane : 2 février 2023
École doctorale : EDMI (Bordeaux)
Financement : bourse INRA-INRIA

Anwar Abouabdallah

01 févr. 2023

These SCIDYN

Identification, développement et test d'indicateurs de la vulnérabilité au changement climatique de systèmes de culture maïsicoles intégrant des pratiques agroécologiques.

Directeurs de thèse : Magali Willaume (INRAE AGIR), Jacques-Eric Bergez (INRAE, AGIR), Stéphane Couture
Soutenance : 9 février 2023
École doctorale : SEVAB
Financement : bourse ACCAF-Région

Marine Albert

01 janv. 2023

These SCIDYN

Analyse de données de transcriptome à l’échelle de cellules uniques pour étudier la maturation postnatale de l’intestin

Directrices de thèse : Martin Beaumont (GenPhySE, INRAE Toulouse) et Nathalie Vialaneix
Ecole doctorale : SEVAB
Etablissement : INP Toulouse
Financement : Projet MetaboWean, financé par l’ANR, programme JCJC

Tania Malonga

01 nov. 2022

These SaAB

Développements de modèles statistiques pour l’analyse et l’intégration de données omiques longitudinales, application aux photogranules

Directrices de thèse : Rémi Servien (LBE, INRAE Narbonne), Nathalie Vialaneix et Marie Tremblay-Franco (Toxalim, INRAE Toulouse)
Début de thèse : 1er octobre 2022
Ecole doctorale : I2S
Etablissement : Université de Montpellier
Financement : Projet PANORAMICS, financé par l’ANR, programme JCJC

Camille Guilmineau

01 oct. 2022

These SaAB

Intégration de données multi-omiques de la peau issues d'expériences multi-groupes

Directrices de thèse : Céline Brouard et Nathalie Vialaneix
Début de thèse : 1er octobre 2022
Ecole doctorale : MITT
Etablissement : Université Toulouse III
Financement : Pierre Fabre Dermo-Cosmétique (CIFRE)

Aurélie Mercadier

01 oct. 2022

These SaAB

Algorithmique des jeux pour la gestion en agro-écologie.

Directeurs de thèse : Hélène Fargier (IRIT, CNRS-Université de Toulouse), Régis Sabbadin
Soutenance : 24 novembre 2022
École doctorale : Mathématiques, Informatique et Télécoms, Toulouse (MITT°.
Établissement : UT3 - Université de Toulouse
Financement : 50 % INRAe + 50 % Région Occitanie

Paul Jourdan

01 févr. 2022

These SCIDYN