SaAB

Filtrage dans les réseaux de contraintes pondérées

Directeur de thèse : Thomas Schiex
Soutenue le : 15/01/2015
Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse
Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
Financement : Contrat ANR

Thi Hong Hiep NGUYEN

01 janv. 2015

Recherche de facteurs génétiques impliqués dans l'élaboration du rendement sous contrainte hydrique chez le tournesol Helianthus annuus par génétique d'association et analyse de liaison dans une population recombinante

Soutenue le : 14/02/2014
Directrice de thèse : Brigitte Mangin
Co-directeur : Patrick Vincourt (Laboratoire des Interactions Plantes Microorganismes, INRA Toulouse)
Ecole doctorale : Sciences Ecologiques,Vétérinaires, Agronomiques, Bioingénieries (Toulouse III)

Elena CADIC

01 févr. 2014

These SaAB

Contribution à la modélisation et l'inférence de réseau de régulation de gènes

Directeur de thèse : Sébastien Gadat (Institut Mathématique de Toulouse)
Co-directeurs : Christine Cierco-Ayrolles et Matthieu Vignes
Soutenue le : 05/12/2014
Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse
Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
Financement : MENRT
Mots-clés : Statistiques, grande dimension, régression, parcimonie, optimisation.
Manuscrit : Manuscrit (français), Soutenance

Magali CHAMPION

01 janv. 2014

These SaAB

Optimisation et design d'enzymes

Responsable : Thomas Schiex
Période : 04/2013 à 08/2013

Jessica DAVIES

01 janv. 2013

Postdoc SaAB

Analyse des bases génétiques et moléculaires de la tolérance à la sécheresse chez le maïs par génétique d'association

Soutenue le : 06/01/2012
Directrice de thèse : Brigitte Mangin
Co-directeur : Pierre Dubreuil (Biogemma, Génétique et Génomique des Céréales)
Ecole doctorale : Sciences Ecologiques,Vétérinaires, Agronomiques, Bioingénieries (Toulouse III)

Sofiane MEZMOUK

01 févr. 2012

These SaAB

Apprentissage de la structure de réseaux bayésiens. Application aux données de génétique-génomique

Soutenue le : 07/12/2012
Directrice de thèse : Brigitte Mangin
Co-directeur : Simon de Givry
Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
Mots-clés : modèle graphique probabiliste, réseau bayésien, optimisation sous contraintes, recherche stochastique gloutonne, apprentissage, génétique génomique, réseau de régulation de gènes
Manuscrit : Manuscrit (français), soutenance

Jimmy VANDEL

01 janv. 2012

These SaAB

Identification et caractérisation de nouveaux ARN non codant chez l'archée hyperthermophile Pyrococcus abyssi

Soutenue le :18/03/2011
Directrice de thèse : Béatrice Clouet-d’Orval (Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaire, Université Toulouse III)
Co-directrice : Christine Gaspin
Co-encadrante : Annick Moisan
Ecole doctorale : Biologie - Santé - Biotechnologies (Toulouse III)
Mots-clés : ARN non codant, Pyrococcus abyssi, Thermococcales, Bio-informatique, Complexes ribonucléoprotéiques
Manuscrit : Manuscrit (français)

Kounthéa PHOK

01 mars 2011

These SaAB

Détection des duplications en tandem au niveau nucléique à l'aide de la théorie des flots

Soutenue le : 28/11/2011
Directeur de thèse : Thomas Schiex
Co-directeur : Thomas Faraut (Laboratoire de Génétique Cellulaire, INRA Toulouse)
Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
Mots clés : Duplication, Tandem, Annotation, Graphe, Flot, ADN, Evolution
Manuscrit : Manuscrit (français)

Eric AUDEMARD

01 févr. 2011

These SaAB

Décompositions fonctionnelles et structurelles dans les modèles graphiques probabilistes appliquées à la reconstruction d’haplotypes

Soutenue le : 12/12/2011
Directeur de thèse : Simon de Givry
Co-directeur : Andres Legarra (Station d’Amélioration Génétique des Animaux, INRA Toulouse)
Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
Mots-clés : optimisation combinatoire, modèle graphique probabiliste, réseau de fonctions de coûts, reconstruction d’haplotypes, pedigree
Manuscrit : Manuscrit (français)

Aurélie FAVIER

01 janv. 2011

These SaAB

Prédiction de gènes d'ARN dans les séquences génomiques

Soutenue le : 15/06/2009
Directeur de thèse : Christine Gaspin
Co-directeurs : Christine Cierco-Ayrolles et Christian Boucher (Laboratoire des Interactions plantes-microorganismes, INRA, Toulouse)
Ecole doctorale : Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques, Bioingénieries (Toulouse III)
Mots-clés : Noncoding RNA detection, Generalised Liner Models, Staphylococcus aureus, HMM, Ralstonia solanacearum, Viterbi training, Compositional bias
Manuscrit : Manuscrit (français)

Ana KOZOMARA

01 janv. 2009

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