SaAB

Deep learning pour l’amélioration d’assemblages

Directeurs de thèse : Matthias Zytnicki (MIAT, INRAE), Raphaël Mourad (MIAT, INRAE), Guillermina Hernandez-Raquet (INRAE, TBI)
Début de thèse : 1 novembre 2024
École doctorale : MITT
Établissement : Université Paul Sabatier
Financement : 50% Région Occitanie + 50% EUR BioEco

Alexis Mergez

01 nov. 2024

Impact de l’environnement nucléotidique sur l’évolution de l’hémagglutinine des virus influenza A

Directeurs de thèse : Romain Volmer (UMR 1225 IHAP INRAE ENVT), Christine Gaspin (UR0875, INRAE, MIAT)
Co-encadrante : Claire Hoede (UR0875, INRAE, MIAT)
Début de thèse : 1er Décembre 2023
École doctorale : SEVAB
Établissement : Université de Toulouse III Paul Sabatier
Financement : ANR « RISKEVOL » et projet européen ICRAD « FLU-SWITCH »,

Aldair Martinez

01 déc. 2023

These SaAB Genotoul Bioinfo

Analyse comparative de données de génomique 3D

Directrices de thèse : Sylvain Foissac (GenPhySE, INRAE Toulouse) et Nathalie Vialaneix
Début de thèse : 1er octobre 2023
Ecole doctorale : SEVAB
Etablissement : INP Toulouse
Financement : DG INRAE

Élise Jorge

01 nov. 2023

Intégration de données multi-omiques appariées à grande échelle

Directrices de thèse : Nathalie Vialaneix (INRAE, MIAT), Andrea Rau (INRAE, GABI)
École doctorale : MITT
Jusqu’à septembre 2024
Établissement : INSA Toulouse
Financement : 100% PEPR Agroécologie et numérique - AgroDiv

Jeong Hwan Ko

01 oct. 2023

Empreintes génomiques de la sélection et effet de la variation génétique sur les phénotypes de deux espèces d’arbres forestier (le chêne sessile) et fruitiers (l’abricotier) : focus sur les variants structuraux

Encadrants de thèse : Véronique Decroocq (INRAE, BFP), Benjamin Linard (INRAE, MIAT)
Début de thèse : 14 septembre 2023
École doctorale : ED154 SVS
Établissement : Université de Bordeaux
Financement : Bourse ministèreille, MESR

Ismaël Blanchard

14 sept. 2023

Méthodes statistiques d'inférence de réseaux de régulation de gènes.

Encadrantes : Nathalie Vialaneix (INRAE, MIAT) & Anne Goelzer (INRAE, MaIAGE)
Période : 2023-2024

Rocher Vincent

01 août 2023

Analyse de données de transcriptome à l’échelle de cellules uniques pour étudier la maturation postnatale de l’intestin

Directrices de thèse : Martin Beaumont (GenPhySE, INRAE Toulouse) et Nathalie Vialaneix
Ecole doctorale : SEVAB
Etablissement : INP Toulouse
Financement : Projet MetaboWean, financé par l’ANR, programme JCJC

01 nov. 2022

Développements de modèles statistiques pour l’analyse et l’intégration de données omiques longitudinales, application aux photogranules

Directrices de thèse : Rémi Servien (LBE, INRAE Narbonne), Nathalie Vialaneix et Marie Tremblay-Franco (Toxalim, INRAE Toulouse)
Début de thèse : 1er octobre 2022
Ecole doctorale : I2S
Etablissement : Université de Montpellier
Financement : Projet PANORAMICS, financé par l’ANR, programme JCJC

01 oct. 2022

Intégration de données multi-omiques de la peau issues d'expériences multi-groupes

Directrices de thèse : Céline Brouard et Nathalie Vialaneix
Début de thèse : 1er octobre 2022
Ecole doctorale : MITT
Etablissement : Université Toulouse III
Financement : Pierre Fabre Dermo-Cosmétique (CIFRE)

Aurélie Mercadier

01 oct. 2022

Optimisation multicritères et design de protéines (SpaceHex)

Responsables : Thomas Schiex
Période : 2022-2024
Projets : SPACEHEX et ANDES

Samuel Buchet

01 févr. 2022