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NMF
NMFProfiler
NMFProfiler is a Python package (available on PyPi) to perform multi-omics integration for samples stratified in groups. It is based on a supervised version of the NMF.
22 août 2024
Citation
URL
doc
Source code
omics integration
NMF
PyPi
Python
Utilisation de la NMF supervisée intégrative pour l'étude d'altérations de la peau
Aurélie Mercadié
,
Eleonore Gravier
,
Gwendal Josse
,
Nathalie Vialaneix
,
Céline Brouard
intégration multi-omiques
apprentissage supervisé
NMF
optimisation proximale
Four functional profiles for fibre and mucin metabolism in the human gut microbiome
Simon Labarthe
,
Sandra Plancade
,
Sébastien Raguideau
,
Florian Plaza Oñate
,
Emmanuelle Le Chatelier
,
Marion Leclerc
,
Béatrice Laroche
HAL
PDF
Citation
DOI
Metagenomics
NMF
Functional profling
Statistical learning
Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiques
Aurélie Mercadié
,
Eleonore Gravier
,
Gwendal Josse
,
Nathalie Vialaneix
,
Céline Brouard
intégration multi-omiques
apprentissage supervisé
NMF
proximal optimization