NMF

NMFProfiler
NMFProfiler is a Python package (available on PyPi) to perform multi-omics integration for samples stratified in groups. It is based on a supervised version of the NMF.
22 août 2024
Citation URL doc Source code
omics integration NMF PyPi Python
NMFProfiler
NMFProfiler
HAL Citation Code
NMF omics integration matrix factorization
Utilisation de la NMF supervisée intégrative pour l'étude d'altérations de la peau
intégration multi-omiques apprentissage supervisé NMF optimisation proximale
Four functional profiles for fibre and mucin metabolism in the human gut microbiome
HAL PDF Citation DOI
Metagenomics NMF Functional profling Statistical learning