These

Impact de l’environnement nucléotidique sur l’évolution de l’hémagglutinine des virus influenza A

Directeurs de thèse : Romain Volmer (UMR 1225 IHAP INRAE ENVT), Christine Gaspin (UR0875, INRAE, MIAT)
Co-encadrante : Claire Hoede (UR0875, INRAE, MIAT)
Début de thèse : 1er Décembre 2023
École doctorale : SEVAB
Établissement : Université de Toulouse III Paul Sabatier
Financement : ANR « RISKEVOL » et projet européen ICRAD « FLU-SWITCH »,

Aldair Martinez

01 déc. 2023

Analyse comparative de données de génomique 3D

Directrices de thèse : Sylvain Foissac (GenPhySE, INRAE Toulouse) et Nathalie Vialaneix
Début de thèse : 1er octobre 2023
Ecole doctorale : SEVAB
Etablissement : INP Toulouse
Financement : DG INRAE

Élise Jorge

01 nov. 2023

These SaAB

Développement d'approches d'apprentissage par renforcement dans les jeux stochastiques pour la coordination en temps réel d'agents de planification autonomes - Application aux jeux de conservation

Directeurs de thèse : Régis Sabbadin (INRAE, MIAT), Meritxell Vinyals (INRAE, MIAT)
Début de thèse : 1er Novembre 2023
École doctorale : MITT
Établissement : Université de Toulouse III Paul Sabatier
Financement : 100% Financement ANR, Projet CHIP-GT

Prasanna Maddila

01 nov. 2023

These DecA

Analyse des graphes de pangénome

Encadrants de thèse : Claire Lemaitre (Inria, Genscale), Thomas Farault (INRAE, GenPhySE), Matthias Zytnicki
Début de thèse : 01 octobre 2023
École doctorale : ED601 MATISSE
Établissement : Université de Rennes-I
Financement : PEPR Agroécologie & Numérique

Siegfried Dubois

01 oct. 2023

These BioComp

Intégration de données multi-omiques appariées à grande échelle

Directrices de thèse : Nathalie Vialaneix (INRAE, MIAT), Andrea Rau (INRAE, GABI)
École doctorale : MITT
Jusqu’à septembre 2024
Établissement : INSA Toulouse
Financement : 100% PEPR Agroécologie et numérique - AgroDiv

Jeong Hwan Ko

01 oct. 2023

These SaAB

Transfert d'annotations génomiques par graphes de pangénomes

Encadrants de thèse : François Sabot (IRD, PANIC), Matthias Zytnicki
Début de thèse : 01 octobre 2023
École doctorale : ED584 GAIA
Établissement : Université de Montpellier
Financement : PEPR Agroécologie & Numérique

Nina Marthe

01 oct. 2023

These BioComp

Empreintes génomiques de la sélection et effet de la variation génétique sur les phénotypes de deux espèces d’arbres forestier (le chêne sessile) et fruitiers (l’abricotier) : focus sur les variants structuraux

Encadrants de thèse : Véronique Decroocq (INRAE, BFP), Benjamin Linard (INRAE, MIAT)
Début de thèse : 14 septembre 2023
École doctorale : ED154 SVS
Établissement : Université de Bordeaux
Financement : Bourse ministèreille, MESR

Ismaël Blanchard

14 sept. 2023

These BioComp

Apprentissage statistique pour l'identification d'OTUs et la caractérisation de la biodiversité.

Directeurs de thèse : Alain Franc (INRA BioGeCo), Olivier Coulaud (INRIA Hiepacs), Nathalie Peyrard
Soutenane : 2 février 2023
École doctorale : EDMI (Bordeaux)
Financement : bourse INRA-INRIA

Anwar Abouabdallah

01 févr. 2023

These SciDyn

Identification, développement et test d'indicateurs de la vulnérabilité au changement climatique de systèmes de culture maïsicoles intégrant des pratiques agroécologiques.

Directeurs de thèse : Magali Willaume (INRAE AGIR), Jacques-Eric Bergez (INRAE, AGIR), Stéphane Couture
Soutenance : 9 février 2023
École doctorale : SEVAB
Financement : bourse ACCAF-Région

Marine Albert

01 janv. 2023

These SciDyn

Analyse de données de transcriptome à l’échelle de cellules uniques pour étudier la maturation postnatale de l’intestin

Directrices de thèse : Martin Beaumont (GenPhySE, INRAE Toulouse) et Nathalie Vialaneix
Ecole doctorale : SEVAB
Etablissement : INP Toulouse
Financement : Projet MetaboWean, financé par l’ANR, programme JCJC

Tania Malonga

01 nov. 2022

These SaAB