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= '''<span style="font-size:x-large">En cours</span>''' =
 
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'''<span style="font-size:large">PostDocs</span>'''
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'''''Reconstruction de réseaux de régulation de résistance pour un couple plante/pathogène, par des méthodes de statistiques et d'intelligence artificielle.&nbsp;'''''<br/> '''Lise Pomiès'''
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*Résumé&nbsp;:
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*Encadrants&nbsp;: Frédérick Garcia, Nathalie Peyrard et Régis Sabbadin.
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*Début de PostDocs&nbsp;: Avril 2020 (12 mois).
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*Financements&nbsp;: ANR, projet PROBITY.
  
 
'''<span style="font-size:large">Thèses</span>'''
 
'''<span style="font-size:large">Thèses</span>'''
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'''''Identification, développement et test d'indicateurs de la vulnérabilité au changement climatique de systèmes de culture maïsicoles intégrant des pratiques agroécologiques.&nbsp;'''''<br/> '''Marine Albert'''
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*Résumé&nbsp;:Nous sommes à la croisée de deux transformations majeures dans le monde agricole : la transition agroécologique et le dérèglement climatique. Pour les systèmes maïsicoles, cette conjonction pose de véritables problèmes. D’un côté l’introduction de pratiques plus agroécologiques (couverts intermédiaires, substitution de la fertilisation de synthèse par des apports organiques ou des légumineuses, cultures en mélange, diversification des cultures, etc...) commence à être bien référencée. De l’autre côté, les impacts sur le fonctionnement des cultures des futures conditions climatiques sont relativement bien connus. Par contre la conjonction des deux demeure terra incognita. L'évaluation des performances des systèmes maïsicoles agroécologiques sous contrainte d’un climat futur est au cœur des questionnements de ce travail de thèse : les nouveaux systèmes maisicoles devront en effet être adaptés à une ressource en eau plus limitée, compétitifs sur le plan économique, plus durables sur le plan et plus justes sur le plan social. Les concepts de durabilité (économique, social et environnemental) et de vulnérabilité (exposition, sensibilité, capacité d’adaptation) permettent d’aider à l’évaluation multicritère des performances des systèmes de culture et/ou des exploitations agricoles. Certaines composantes sont déjà plus ou moins bien renseignées. Cependant, l’analyse des capacités d’adaptation des agriculteurs est encore peu documentée et moins étudiée que la sensibilité des systèmes de cultures aux adversités climatiques. Les capacités adaptatives des agriculteurs reposent certes sur les connaissances des processus biophysiques et des caractéristiques socio-économiques des agriculteurs, mais aussi sur la prise en considération du processus de décision de l’exploitant, sa perception et ses préférences concernant le changement climatique ou l’adoption de l’innovation. Le projet de thèse concerne l’identification, le développement et le test d’indicateurs de la vulnérabilité au changement climatique de systèmes agricoles maïsicoles intégrant des pratiques agroécologiques, en prenant mieux en compte la capacité d’adaptation des exploitants et leurs processus de décision, et en intégrant mieux les échelles de la parcelle et de l’exploitation.
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*Directeurs de thèse&nbsp;: Magali Willaume (INRAE AGIR), Jacques-Eric Bergez (INRAE, AGIR), Stéphane Couture
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*Début de thèse&nbsp;: 1 décembre 2019
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*École doctorale&nbsp;: SEVAB
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*Établissement&nbsp;:
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*Financement&nbsp;: bourse ACCAF-Région
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'''''Apprentissage statistique pour l'identification d'OTUs et la caractérisation de la biodiversité.&nbsp;'''''<br/> '''Anwar Abouabdallah'''
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*Résumé&nbsp;:Les outils classiques d’évaluation de la biodiversité (indices de type Shannon) restent une description limitée de la structure de cette diversité. Un premier enjeu est de proposer un résumé non scalaire de la diversité qui serait à la fois plus fidèle et plus riche. Un second enjeu est que ce résumé puisse être calculé également à l’échelle massive des jeux de données actuel issus de NGS, où les OTUs remplacent les espèces. Nous proposons une méthode d’apprentissage non supervisé pour la construction des OTUs à partir des distances moléculaires où le jeu de données (les distances) est considéré comme la réalisation d’un modèle SBM (Stochastic Block Model). Notre hypothèse est que les paramètres de ce modèle, qui quantifient la structure entre les classes, sont un bon résumé de la diversité de l’échantillon. Dans un premier temps, nous validerons le choix du modèle SBM en l’appliquant à un petit jeu de données issu du barcoding d’un échantillon d’arbres de Guyane, également identifiés botaniquement. Nous comparerons les classes d’individus obtenues par le SBM à celles issues de la classification botanique et à celles émanant de la classification hiérarchique ascendante des distances. Les paramètres du modèle SBM sont habituellement estimés par l’algorithme EM variationnel, coûteux en calcul.  L’utilisation de ce modèle est actuellement limitée à des jeux de données de petite taille (quelques milliers d’individus). La deuxième partie de cette thèse consiste à permettre un passage à l’échelle de l’estimation du modèle SBM. Pour cela nous envisageons de remplacer l’approche variationnelle de la loi jointe a posteriori des affectations aux classes par une approche par « tenseurs train », en espérant réduire un peu plus la complexité de l’algorithme EM. En cas de succès, ce travail devrait permettre d’appliquer les modèles SBM à l’échelle des jeux de données massifs issus de NGS en metabarcoding.
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*Mots-clé&nbsp;: biodiversité, construction d'OTU, apprentissage non supervisé,Stochastic Block Model, Calcul tensoriel
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*Directeurs de thèse&nbsp;: Alain Franc (INRA BioGeCo), Olivier Coulaud (INRIA Hiepacs), Nathalie Peyrard
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*Début de thèse&nbsp;: 1 octobre 2019
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*École doctorale&nbsp;: EDMI (Bordeaux)
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*Établissement&nbsp;:
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*Financement&nbsp;: bourse INRA-INRIA
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'''''Algorithmique des jeux pour la gestion en agro-écologie.&nbsp;'''''<br/> '''Paul Jourdan'''
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*Résumé&nbsp;: Cette thèse vise à développer de nouvelles approches de la théorie des jeux algorithmiques, au croisement des jeux hypergraphiques et des jeux bayésiens, et plus généralement pour un ensemble de cadres de la famille des jeux complexes (jeux séquentiels, jeux stochastiques, Processus Décisionnels de Markov multi-agents). Ces nouvelles approches seront mises en œuvre pour aborder des problèmes d’agroécologie, autour de la conservation de la biodiversité et de la gestion des services écosystémiques. L'enjeu de cette thèse est l'étude des liens entre jeux à information incomplète, jeux hypergraphiques et jeux séquentiels, des points de vue théorique et algorithmique. Nous démontrerons l'intérêt pratique de ces avancées pour la gestion de la biodiversité et des services écosystémiques à l'échelle d'un territoire. A cet effet, nous mobiliserons des partenaires écologues avec lesquels des collaborations sont en cours, sur les liens entre décision séquentielle dans l'incertain et écologie.
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*Directeurs de thèse&nbsp;: Hélène Fargier (IRIT, CNRS-Université de Toulouse), Régis Sabbadin
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*Début de thèse&nbsp;: 1 octobre 2019
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*École doctorale&nbsp;: Mathématiques, Informatique et Télécoms, Toulouse (MITT°.
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*Établissement&nbsp;: UT3 - Université de Toulouse
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*Financement&nbsp;: 50&nbsp;% INRAe + 50&nbsp;% Région Occitanie
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'''''Améliorer les prévisions à court et moyen termes des modèles agronomiques en prenant mieux en compte l'incertitude des prévisions météorologiques.&nbsp;'''''<br/> '''Ivana Aleksovska'''
 
'''''Améliorer les prévisions à court et moyen termes des modèles agronomiques en prenant mieux en compte l'incertitude des prévisions météorologiques.&nbsp;'''''<br/> '''Ivana Aleksovska'''
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*Financement&nbsp;: 50&nbsp;% [http://www.hdigitag.fr/fr/ #DigitAg] + 50&nbsp;% ACTA-Arvalis-IFV  
 
*Financement&nbsp;: 50&nbsp;% [http://www.hdigitag.fr/fr/ #DigitAg] + 50&nbsp;% ACTA-Arvalis-IFV  
  
'''''Optimisation en haute dimension pour l'aéodynamique interne et externe de véhicules''.'''<br/> [https://sites.google.com/site/davidgaudrie '''David Gaudrie''']
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'''''La représentation compacte des jeux ordinaux.'''''<br/> '''Arij Azzabi'''
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*Directeurs de thèse&nbsp;: Nahla Ben Amor (ISG Tunis), Régis Sabbadin
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*Début de thèse&nbsp;: 1 novembre 2017
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*École doctorale&nbsp;: Informatique et Sciences de gestion
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*Établissement&nbsp;: Institut Supérieur de Gestion, Tunis.  
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*Financement&nbsp;: ISG
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= '''<span style="font-size:x-large">Ils sont passés par l'unité</span>''' =
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<span style="font-size:large">'''Thèses'''</span>
  
*Directeurs de thèse&nbsp;: Rodolphe Le Riche (LIMOS, Mines Saint Etienne)
 
*Co-directeur&nbsp;: Victor Picheny
 
*Début de thèse&nbsp;: 7 novembre 2016
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Saint Etienne
 
*Etablissement&nbsp;: Mines Saint Etienne
 
*Financement&nbsp;: CIFRE PSA
 
  
'''''Métamodélisation et optimisation robuste&nbsp;: application à la recherche d'idéotypes de plantes sous incertitude climatique''.'''<br/> [https://sites.google.com/view/leonardtorossian/home '''Léonard Torossian''']
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'''''Métamodélisation et optimisation robuste&nbsp;: application à la recherche d'idéotypes de plantes sous incertitude climatique.'''''<br/> [https://sites.google.com/view/leonardtorossian/home '''Léonard Torossian''']
  
 
*Directeurs de thèse&nbsp;: Aurélien Garivier (IMT) et Robert Faivre  
 
*Directeurs de thèse&nbsp;: Aurélien Garivier (IMT) et Robert Faivre  
 
*Co-directeur&nbsp;: Victor Picheny  
 
*Co-directeur&nbsp;: Victor Picheny  
*Début de thèse&nbsp;: 1 novembre 2016
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*Soutenue le&nbsp;: 17 décembre 2019
 
*Ecole doctorale&nbsp;: MITT  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: MITT  
 
*Etablissement&nbsp;: UPS  
 
*Etablissement&nbsp;: UPS  
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*Labellisation&nbsp;: [http://www.hdigitag.fr/fr/ #DigitAg]  
 
*Labellisation&nbsp;: [http://www.hdigitag.fr/fr/ #DigitAg]  
  
'''''Conservation based on ecosystem complexity using network theory.'''''<br/> '''Hui xiao'''
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'''''Conservation based on ecosystem complexity using network theory.'''''<br/> [https://cbcs.centre.uq.edu.au/profile/988/hui-xiao '''Hui Xiao''']
  
 
*Directrice de thèse&nbsp;: Eve MacDonald-Madden (Univ. of Queensland)  
 
*Directrice de thèse&nbsp;: Eve MacDonald-Madden (Univ. of Queensland)  
 
*Co-directeurs&nbsp;: Iadine Chadès (CSIRO) et Régis Sabbadin.  
 
*Co-directeurs&nbsp;: Iadine Chadès (CSIRO) et Régis Sabbadin.  
*Début de thèse&nbsp;: 10 avril 2015
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*Thèse obtenue en&nbsp;: 2019
 
*Ecole doctorale&nbsp;: School of Geography,&nbsp; Planning and Environmental Management  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: School of Geography,&nbsp; Planning and Environmental Management  
 
*Etablissement&nbsp;: University of Queensland  
 
*Etablissement&nbsp;: University of Queensland  
 
*Financement&nbsp;: UQ  
 
*Financement&nbsp;: UQ  
  
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'''''Optimisation en haute dimension pour l'aéodynamique interne et externe de véhicules''.'''<br/> [https://sites.google.com/site/davidgaudrie '''David Gaudrie''']
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*Directeurs de thèse&nbsp;: Rodolphe Le Riche (LIMOS, Mines Saint Etienne)
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*Co-directeur&nbsp;: Victor Picheny
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*Soutenue le&nbsp;: 28 octobre 2019
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*Ecole doctorale&nbsp;: Saint Etienne
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*Etablissement&nbsp;: Mines Saint Etienne
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*Financement&nbsp;: CIFRE PSA
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*[[https://sites.google.com/site/davidgaudrie/thesis]]
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'''''''Méthodes d'optimisation combinatoire en programmation mathématique. Application à la conception des systèmes de verger-maraîcher.'''<br/> '''Sara Maqrot'''
  
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*Directeurs de thèse&nbsp;: Simon De Givry, Gauthier Quesnel et Marc Tchamitchian (UR Ecodéveloppement, INRAE Avignon)
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*Soutenue le&nbsp;: 23 septembre 2019
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*Ecole doctorale&nbsp;: MITT
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*Etablissement&nbsp;: Université de toulouse
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*Financement&nbsp;: MITT
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*[[http://thesesups.ups-tlse.fr/4447/1/2019TOU30131.pdf Manuscrit]]
  
= '''<span style="font-size:x-large">Ils sont passés par l'unité</span>''' =
 
  
<span style="font-size:large">'''Thèses'''</span>
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'''''Vers des agents cognitifs, affectifs et sociaux dans la simulation.'''''<br/> '''Mathieu Bourgais'''
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*Directeur de thèse&nbsp;: Laurent Vercouter
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*Co-directeur&nbsp;: Patrick Taillandier
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*Début de thèse&nbsp;: 1 octobre 2015
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*Soutenue le&nbsp;: 30 novembre 2018
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*Ecole doctorale&nbsp;: SPMII
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*Etablissement&nbsp;: INSA de Rouen
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*Financement&nbsp;: ANR ACTEUR
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*[[https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01959903v3/document Manuscrit]]
  
 
'''''Un modèle de Markov caché pour la dynamique des adventices dans un agrosystème.'''''<br/> '''Sebastian Le Coz'''
 
'''''Un modèle de Markov caché pour la dynamique des adventices dans un agrosystème.'''''<br/> '''Sebastian Le Coz'''
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*Etablissement&nbsp;: UPS  
 
*Etablissement&nbsp;: UPS  
 
*Financement&nbsp;: 50% région Midi-Pyrénées, 50% projet Agrobiose  
 
*Financement&nbsp;: 50% région Midi-Pyrénées, 50% projet Agrobiose  
*Manuscrit&nbsp;: [[Media:ManuscritThese_LeCoz.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:SlidesSoutenance_LeCoz.pdf|transparents de la soutenance]]  
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*[[Media:ManuscritThese_LeCoz.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:SlidesSoutenance_LeCoz.pdf|transparents de la soutenance]]  
  
'''''Réseau bayésien dynamique étiqueté&nbsp;: cadre et apprentissage de structure pour application aux réseaux écologiques'''''<br/> '''Etienne Auclair'''
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'''''Réseau bayésien dynamique étiqueté&nbsp;: cadre et apprentissage de structure pour application aux réseaux écologiques.'''''<br/> '''Etienne Auclair'''
  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Régis Sabbadin  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Régis Sabbadin  
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*Etablissement&nbsp;: UPS  
 
*Etablissement&nbsp;: UPS  
 
*Financement&nbsp;: MITT  
 
*Financement&nbsp;: MITT  
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*[[Media:TheseAuclair.pdf|Manuscrit]], [[Media:Diapo_soutenance_Auclair.pdf|transparents de la soutenance]]
  
'''''Modeling the process of operational decision-making in agriculture: a bounded rationality approach.'''''<br/> '''Charlotte DAYDE'''
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'''''Comprendre le processus de prise de décision opérationnelle en agriculture&nbsp;: une approche en rationalité limitée.'''''<br/> '''Charlotte Dayde'''
  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Roger Martin-Clouaire  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Roger Martin-Clouaire  
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*Etablissement&nbsp;: INPT  
 
*Etablissement&nbsp;: INPT  
 
*Financement&nbsp;: 50% MIA, 50% SAE2  
 
*Financement&nbsp;: 50% MIA, 50% SAE2  
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*[[https://oatao.univ-toulouse.fr/17707/1/dayde.pdf Manuscrit]]
  
'''''Résolution de processu décisionnels de Markov à espace d'état et d'action factorisés. Application en agroécologie.'''''<br/> '''Julia RADOSZYCKI'''
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'''''Résolution de processu décisionnels de Markov à espace d'état et d'action factorisés. Application en agroécologie.'''''<br/> '''Julia Radoszycki'''
  
 
*Directrice de thèse&nbsp;: Nathalie Peyrard  
 
*Directrice de thèse&nbsp;: Nathalie Peyrard  
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*Etablissement&nbsp;: INSA  
 
*Etablissement&nbsp;: INSA  
 
*Financement&nbsp;: MITT  
 
*Financement&nbsp;: MITT  
*Mots-clefs&nbsp;: processus décisionnel de Markov, optimisation continue, méthodes de gradient, inférence dans les modèles graphiques, écoinformatique, modélisation mathématique, paysage, services écosystémiques, pollinisation, adventices
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*[[Media:These-Radoszycki-2015.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:presentation_soutenance_Radoszycki.pdf|transparents de la soutenance]]  
*Manuscrit&nbsp;: [[Media:These-Radoszycki-2015.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:presentation_soutenance_Radoszycki.pdf|transparents de la soutenance]]  
 
  
'''''Outiller l'adaptation des élevages fourragers au changement climatique: de l'analyse de la vulnérabilité à la conception participative de systèmes d'élevage.'''''<br/> '''Marion SAUTIER'''
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'''''Outiller l'adaptation des élevages fourragers au changement climatique: de l'analyse de la vulnérabilité à la conception participative de systèmes d'élevage.'''''<br/> '''Marion Sautier'''
  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Roger Martin-Clouaire  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Roger Martin-Clouaire  
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*Etablissement&nbsp;: Université Paul Sabatier (Toulouse III)  
 
*Etablissement&nbsp;: Université Paul Sabatier (Toulouse III)  
 
*Financement&nbsp;: 100% INRA (ASC)  
 
*Financement&nbsp;: 100% INRA (ASC)  
*Résumé&nbsp;: Les systèmes de production agricole sont exposés au changement climatique dès lors qu’ils mobilisent des ressources dépendantes du climat. L’enjeu pour la communauté scientifique est de produire des connaissances permettant aux praticiens d’anticiper les effets du changement climatique sur leur système, et d’élaborer des méthodes et outils pour s’y adapter. Les systèmes d’élevage herbagers sont particulièrement concernés par le changement climatique étant donné qu’ils dépendent de la ressource fourragère, dont la saisonnalité et la productivité sont fortement liées au climat. Leur adaptation au changement climatique nécessite d’anticiper les tendances et la variabilité interannuelle. L'objectif de la thèse est de proposer une analyse de la vulnérabilité des systèmes d’élevage herbagers au changement et à la variabilité climatiques, ainsi qu’une méthode de conception de ces systèmes. La thèse repose sur la spécification et l’application du cadre de la vulnérabilité à l’échelle de l’exploitation d’élevage, et la mise en oeuvre d’une méthode de conception participative. La démarche d’ensemble articule la représentation de l’exposition au climat en lien avec les contraintes de gestion des élevages, l’analyse rétrospective des dynamiques des élevages et la construction participative de systèmes d’élevage moins vulnérables au changement et à la variabilité climatiques. Nous avons mis en oeuvre cette démarche sur les élevages du Sud-Ouest de la France. Nous avons mis en évidence que ces élevages, bien qu’exposés à l’évolution de la saisonnalité de la production herbagère et des types d’années fourragères les plus fréquents, disposent de capacités d’adaptation structurelles et organisationnelles suffisantes pour faire face au changement climatique à horizon 2085. Nous avons également identifié les caractéristiques des exploitations les plus sensibles et les adaptations les plus efficaces face à la variabilité climatique. Outre son intérêt pour comprendre et réduire la vulnérabilité des élevages herbagers à la variabilité et au changement climatiques, cette méthodologie à la fois réflexive et interactive pourrait être utilisée pour communiquer auprès des éleveurs et des organismes de développement agricole sur le changement climatique, ses effets et les adaptations possibles des élevages.
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*[[Media:These-Sautier-2013.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:Transparents-soutenance-Sautier2013.pdf|transparents de la soutenance]]  
*Manuscrit&nbsp;: [[Media:These-Sautier-2013.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:Transparents-soutenance-Sautier2013.pdf|transparents de la soutenance]]  
 
  
'''''Approche modulaire pour la planification continue. Application à la conduite des systèmes de cultures.'''''<br/> '''Mahuna AKPLOGAN'''
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'''''Approche modulaire pour la planification continue. Application à la conduite des systèmes de cultures.'''''<br/> '''Mahuna Akplogan'''
  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Frédérick Garcia  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Frédérick Garcia  
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*Soutenue le&nbsp;: 15 Mai 2013  
 
*Soutenue le&nbsp;: 15 Mai 2013  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Mathématiques Informatique Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Mathématiques Informatique Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)  
*Résumé&nbsp;: Au cours des dernières années, dans l'optique de faire face aux changements environnementaux et économiques, les chercheurs en agronomie ont développé de nombreux modèles conceptuels relatifs à la conduite des systèmes de production agricoles. La simulation et le contrôle de ces systèmes permettent de reproduire les dynamiques d'interaction entre des entités autonomes et hétérogènes comprenant un agent (agriculteur). Ces travaux sont essentiels aujourd'hui où l'utilisation de la simulation devient de plus en plus prépondérante dans la conception des systèmes complexes tels que sont les systèmes de production agricole. Dans le cadre de cette thèse, nous nous sommes intéressés à la conception des systèmes complexes autonomes opérant dans un environnement dynamique et incertain. Nous expliquons que la conduite des systèmes de culture d'une exploitation agricole est un problème multi-échelles spatiales et temporelles. La structure de l'exploitation étant fixée, elle intègre trois types de décision qui sont&nbsp;: l'allocation des cultures (à long terme), choix du mode de conduite des cultures, les itinéraires technique (à moyen terme) et l'ordonnancement des opérations agricoles journalières (à court terme). Ces problèmes de décision étant de nature différente, nous avons développé pour chacun d'eux des méthodes de planification spécifiques. Nous proposons d'aborder l'allocation des cultures comme un problème de satisfaction de contraintes pondérées (WCSP) où l'utilité de l'allocation est évaluée par une fonction de coût globale. Les modes de conduite des cultures étant prédéfinis, nous utilisons une approche de planification temporelle et hiérarchique (HTN et STN) dans laquelle l'heuristique de décomposition est une fonction globale permettant ainsi, de prendre en compte les inter-dépendances entre les effets de chaque mode de conduite. Enfin, l'approche que nous proposons pour l'ordonnancement des opérations agricoles est basée sur un modèle de programmation linéaire. Pour appréhender ces différents problèmes de décision, nous proposons une architecture systémique nommée «&nbsp;Safihr&nbsp;». Celle-ci est capable de prendre en compte l'entrelacement en ligne de plusieurs planificateurs spécifiques. Cette architecture repose sur le cadre des systèmes à événements discrets (DEVS). L'agent agriculteur est vu comme un système hiérarchique, dynamique et distribué en interaction avec son environnement physique. Chacun des planificateurs est vu comme un système de contrôle indépendant. Safihr intègre les mécanismes permettant de faire coopérer différents planificateurs spécifiques au sein d'un même système. Cette architecture a été testée sur une exploitation virtuelle de 180 ha, cultivant 4 cultures annuelles, chacune pouvant être cultivée selon 3 itinéraires techniques différents.
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*[[Media:TheseAkplogan.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:Transparents-soutenance-Akplogan.pdf|transparents de la soutenance]]  
*Mots-clés&nbsp;: Agent orienté simulation, Systèmes à événement discrets, CSP pondérés, Planification hiérarchique temporelle, Allocation de culture, Conduite des systèmes de culture
 
*Manuscrit&nbsp;: [[Media:TheseAkplogan.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:Transparents-soutenance-Akplogan.pdf|transparents de la soutenance]]  
 
  
'''''Développement d'une méthode adaptative d'échantillonnage spatialisé pour caractériser la composition du stock semencier des espèces adventices à l'échelle de la mosaïque paysagère.'''''<br/> '''Mathieu BONNEAU'''
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'''''Développement d'une méthode adaptative d'échantillonnage spatialisé pour caractériser la composition du stock semencier des espèces adventices à l'échelle de la mosaïque paysagère.'''''<br/> '''Mathieu Bonneau'''
  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Régis Sabbadin  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Régis Sabbadin  
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*Soutenue le&nbsp;: 30 Novembre 2012  
 
*Soutenue le&nbsp;: 30 Novembre 2012  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Mathématiques Informatique Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Mathématiques Informatique Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)  
*Résumé&nbsp;: Ce travail de thèse propose deux contributions: (i) la formalisation et la résolution approchée du problème d'échantillonnage adaptatif optimal dans les champs de Markov et (ii) la modélisation du problème d’échantillonnage d’une espèce adventice au sein d’une parcelle cultivée et la conception de stratégies d’échantillonnage adaptatives de cette espèce. Pour le premier point, nous avons d’abord formulé le problème du choix d’une stratégie d’échantillonnage adaptative optimale comme un Processus Décisionnel de Markov (PDM) à horizon fini. Nous avons ensuite proposé un algorithme de résolution approchée de tout PDM à horizon fini dont le modèle est connu. Cet algorithme, nommé Least Square Dynamic Programming (LSDP), combine les concepts de programmation dynamique et d’apprentissage par renforcement. Il a ensuite été adapté pour la conception de stratégies d’échantillonnage adaptatives pour tout type de champ de Markov et tout type de coût d’observation. En pratique, l'algorithme LSDP permet une résolution approchée de problèmes d'échantillonnage de plus grande taille qu'avec la plupart des algorithmes classiques d’apprentissage par renforcement. Pour le deuxième point, nous avons d’abord modélisé la répartition spatiale d’une espèce adventice à l’aide des champs de Markov. Un modèle de coût d’échantillonnage d’une espèce adventice a également été proposé. Ces deux modèles ont ensuite été utilisés pour concevoir de nouvelles stratégies d’échantillonnage adaptatives d’une espèce. Une étude sur données réelles a démontré la supériorité des stratégies adaptatives sur des stratégies statiques, classiquement utilisées en échantillonnage adventice.
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*[[Media:TheseMathieu_BONNEAU.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:Slides_soutenance_BONNEAU.pdf|transparents de la soutenance]]  
*Mots-clés&nbsp;: échantillonnage adaptatif, champ de Markov, processus décisionnel de Markov, apprentissage par renforcement, programmation dynamique, batch, adventice, coût d'échantillonnage
 
*Manuscrit&nbsp;: [[Media:TheseMathieu_BONNEAU.pdf|Manuscrit (français)]], [[Media:Slides_soutenance_BONNEAU.pdf|transparents de la soutenance]]  
 
  
'''''Analyse des interactions dynamiques entre le développement de la plante hôte, l’architecture du couvert et le développement d’une épidémie de maladie fongique aérienne&nbsp;: cas du pathosystème pois/ascochytose.'''''<br/> '''Benjamin RICHARD'''
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'''''Analyse des interactions dynamiques entre le développement de la plante hôte, l’architecture du couvert et le développement d’une épidémie de maladie fongique aérienne&nbsp;: cas du pathosystème pois/ascochytose.'''''<br/> '''Benjamin Richard'''
  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Bernard Tivoli&nbsp; (UMR BiO3P, INRA Rennes)  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Bernard Tivoli&nbsp; (UMR BiO3P, INRA Rennes)  
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*Soutenue le&nbsp;: 19 Novembre 2012  
 
*Soutenue le&nbsp;: 19 Novembre 2012  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Vie Agro Santé (Agrocampus Ouest)  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Vie Agro Santé (Agrocampus Ouest)  
*Résumé&nbsp;: L’architecture du couvert constitue un levier susceptible de limiter le développement épidémique des mycoses aériennes des plantes. La grande variabilité des caractéristiques architecturales du pois fait du pathosystème Mycosphaerella pinodes/pois un candidat idéal pour une telle étude. Deux hypothèses sont testées pour expliquer la montée de la maladie de la base vers le haut du couvert en cours de culture&nbsp;: i) la présence d’un gradient de réceptivité des organes du pois liée à leur niveau de sénescence, et ii) la présence d’un gradient d’humectation avec une durée d’humectation plus longue à la base des couverts. Au champ, trois cultivars ont été semés à plusieurs densités afin d’obtenir divers scénarios architecturaux. Les couverts les plus denses présentent des niveaux de sénescence plus élevés générés par les indices de surface foliaire des étages supérieurs ainsi qu’un niveau de maladie plus sévère. Une étude analytique complémentaire, réalisée en conditions contrôlées, a montré la plus grande réceptivité à l'ascochytose des organes sénescents. Les mesures microclimatiques montrent une augmentation générale de la durée d’humectation au sein des couverts par rapport à l’extérieur durant les périodes pluvieuses, seules périodes favorables à l’infection d’après notre modélisation adaptée du modèle de Magarey et al. Nos résultats montrent ainsi que l’architecture impacte directement et indirectement le développement épidémique, mais ne peut fournir seule un échappement total à la maladie&nbsp;; elle doit donc être combinée à d’autres méthodes de lutte.
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*[[Media:B.Richard_-_Manuscrit.pdf|Manuscrit (français)]]  
*Mots-clés&nbsp;: Archidemio – architecture des couverts – durée d'humectation – indice de surface foliaire – microclimat – modèle de Magarey – Mycosphaerella pinodes – Pisum sativum – réceptivité – sénescence
 
*Manuscrit&nbsp;: [[Media:B.Richard_-_Manuscrit.pdf|Manuscrit (français)]]  
 
  
'''''Les décisions d'assolement&nbsp;: une approche par modélisation et simulation a l'échelle de l'exploitation agricole''.'''<br/> '''Jérôme DURY'''
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'''''Les décisions d'assolement&nbsp;: une approche par modélisation et simulation a l'échelle de l'exploitation agricole''.'''<br/> '''Jérôme Dury'''
  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Jacques-Eric Bergez (UMR AGIR, INRA Toulouse)  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Jacques-Eric Bergez (UMR AGIR, INRA Toulouse)  
Ligne 138 : Ligne 205 :
 
*Soutenue le&nbsp;: 9 Décembre 2011  
 
*Soutenue le&nbsp;: 9 Décembre 2011  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques Bioingénieries (Toulouse III)  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques Bioingénieries (Toulouse III)  
*Résumé&nbsp;: L'assolement, c'est à dire l'attribution des cultures sur les différentes parcelles de l'exploitation agricole, est un élément fondamental de la stratégie de l'agriculteur. Il provient d'un équilibre entre des contraintes et objectifs multiples alliant les dimensions sociale' économique' agronomique et environnementale (utilisation des ressources). Il reflète deux dimensions: une dimension stratégique (lié aux orientations de l'exploitation) et une dimension tactique plus lié à l'adaptation des attributions suite à des contextes changeant (climatique' prix). Afin représenter ces deux niveaux et ainsi structurer les enjeux relatifs aux choix d'assolement à l'échelle de l'exploitation nous proposons une approche basées sur&nbsp;: i) une analyse du processus décisionnel par le biais d'enquêtes en exploitation; ii) une modélisation dynamique aussi bien sur des processus biophysiques (modèles de culture) que sur des processus de gestion (modèle de décision) pour comprendre et simuler.
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*[[Media:Dury.pdf|Manuscrit (anglais)]]  
*Mots-clés&nbsp;: assolement, processus de décision, modèle agent couplé, simulation, RECORD, incertitude, exploitation agricole, risque
 
*Manuscrit&nbsp;: [[Media:Dury.pdf|Manuscrit (anglais)]]  
 
  
'''''Analyse et conception de systèmes fourragers flexibles par modélisation systémique et simulation dynamique'''''<i>.</i><br/> '''Guillaume MARTIN'''
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'''''Analyse et conception de systèmes fourragers flexibles par modélisation systémique et simulation dynamique'''''<i>.</i><br/> '''Guillaume Martin'''
  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Roger Martin-Clouaire  
 
*Directeur de thèse&nbsp;: Roger Martin-Clouaire  
Ligne 149 : Ligne 214 :
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques Bioingénieries (Toulouse III)  
 
*Ecole doctorale&nbsp;: Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques Bioingénieries (Toulouse III)  
 
*Mots-clés&nbsp;: système fourrager, modélisation, simulation, diversité, flexibilité, comportement gestionnaire  
 
*Mots-clés&nbsp;: système fourrager, modélisation, simulation, diversité, flexibilité, comportement gestionnaire  
*Manuscrit&nbsp;: [[Media:Martin-1.pdf|Manuscrit (français)]]  
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*[[Media:Martin-1.pdf|Manuscrit (français)]]  
  
 
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*Laboratoires&nbsp;: Collaboration entre INRA-MIAT et INRA-DYNAFOR  
 
*Laboratoires&nbsp;: Collaboration entre INRA-MIAT et INRA-DYNAFOR  
  
'''''Design of mathematics and artificial intelligence tools for the mapping and sustainable management of crops pests using autonomous UAVs.'''''<br/> '''Alexandre ALBORE'''
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'''''Design of mathematics and artificial intelligence tools for the mapping and sustainable management of crops pests using autonomous UAVs.'''''<br/> '''Alexandre Albore'''
  
 
*Responsables: Nathalie Peyrard,&nbsp; Régis Sabbadin et Florent Teichtel  
 
*Responsables: Nathalie Peyrard,&nbsp; Régis Sabbadin et Florent Teichtel  

Version actuelle datée du 22 septembre 2020 à 08:13



En cours

PostDocs

Reconstruction de réseaux de régulation de résistance pour un couple plante/pathogène, par des méthodes de statistiques et d'intelligence artificielle. 
Lise Pomiès

  • Résumé :
  • Encadrants : Frédérick Garcia, Nathalie Peyrard et Régis Sabbadin.
  • Début de PostDocs : Avril 2020 (12 mois).
  • Financements : ANR, projet PROBITY.

Thèses

Identification, développement et test d'indicateurs de la vulnérabilité au changement climatique de systèmes de culture maïsicoles intégrant des pratiques agroécologiques. 
Marine Albert

  • Résumé :Nous sommes à la croisée de deux transformations majeures dans le monde agricole : la transition agroécologique et le dérèglement climatique. Pour les systèmes maïsicoles, cette conjonction pose de véritables problèmes. D’un côté l’introduction de pratiques plus agroécologiques (couverts intermédiaires, substitution de la fertilisation de synthèse par des apports organiques ou des légumineuses, cultures en mélange, diversification des cultures, etc...) commence à être bien référencée. De l’autre côté, les impacts sur le fonctionnement des cultures des futures conditions climatiques sont relativement bien connus. Par contre la conjonction des deux demeure terra incognita. L'évaluation des performances des systèmes maïsicoles agroécologiques sous contrainte d’un climat futur est au cœur des questionnements de ce travail de thèse : les nouveaux systèmes maisicoles devront en effet être adaptés à une ressource en eau plus limitée, compétitifs sur le plan économique, plus durables sur le plan et plus justes sur le plan social. Les concepts de durabilité (économique, social et environnemental) et de vulnérabilité (exposition, sensibilité, capacité d’adaptation) permettent d’aider à l’évaluation multicritère des performances des systèmes de culture et/ou des exploitations agricoles. Certaines composantes sont déjà plus ou moins bien renseignées. Cependant, l’analyse des capacités d’adaptation des agriculteurs est encore peu documentée et moins étudiée que la sensibilité des systèmes de cultures aux adversités climatiques. Les capacités adaptatives des agriculteurs reposent certes sur les connaissances des processus biophysiques et des caractéristiques socio-économiques des agriculteurs, mais aussi sur la prise en considération du processus de décision de l’exploitant, sa perception et ses préférences concernant le changement climatique ou l’adoption de l’innovation. Le projet de thèse concerne l’identification, le développement et le test d’indicateurs de la vulnérabilité au changement climatique de systèmes agricoles maïsicoles intégrant des pratiques agroécologiques, en prenant mieux en compte la capacité d’adaptation des exploitants et leurs processus de décision, et en intégrant mieux les échelles de la parcelle et de l’exploitation.
  • Directeurs de thèse : Magali Willaume (INRAE AGIR), Jacques-Eric Bergez (INRAE, AGIR), Stéphane Couture
  • Début de thèse : 1 décembre 2019
  • École doctorale : SEVAB
  • Établissement :
  • Financement : bourse ACCAF-Région


Apprentissage statistique pour l'identification d'OTUs et la caractérisation de la biodiversité. 
Anwar Abouabdallah

  • Résumé :Les outils classiques d’évaluation de la biodiversité (indices de type Shannon) restent une description limitée de la structure de cette diversité. Un premier enjeu est de proposer un résumé non scalaire de la diversité qui serait à la fois plus fidèle et plus riche. Un second enjeu est que ce résumé puisse être calculé également à l’échelle massive des jeux de données actuel issus de NGS, où les OTUs remplacent les espèces. Nous proposons une méthode d’apprentissage non supervisé pour la construction des OTUs à partir des distances moléculaires où le jeu de données (les distances) est considéré comme la réalisation d’un modèle SBM (Stochastic Block Model). Notre hypothèse est que les paramètres de ce modèle, qui quantifient la structure entre les classes, sont un bon résumé de la diversité de l’échantillon. Dans un premier temps, nous validerons le choix du modèle SBM en l’appliquant à un petit jeu de données issu du barcoding d’un échantillon d’arbres de Guyane, également identifiés botaniquement. Nous comparerons les classes d’individus obtenues par le SBM à celles issues de la classification botanique et à celles émanant de la classification hiérarchique ascendante des distances. Les paramètres du modèle SBM sont habituellement estimés par l’algorithme EM variationnel, coûteux en calcul. L’utilisation de ce modèle est actuellement limitée à des jeux de données de petite taille (quelques milliers d’individus). La deuxième partie de cette thèse consiste à permettre un passage à l’échelle de l’estimation du modèle SBM. Pour cela nous envisageons de remplacer l’approche variationnelle de la loi jointe a posteriori des affectations aux classes par une approche par « tenseurs train », en espérant réduire un peu plus la complexité de l’algorithme EM. En cas de succès, ce travail devrait permettre d’appliquer les modèles SBM à l’échelle des jeux de données massifs issus de NGS en metabarcoding.
  • Mots-clé : biodiversité, construction d'OTU, apprentissage non supervisé,Stochastic Block Model, Calcul tensoriel
  • Directeurs de thèse : Alain Franc (INRA BioGeCo), Olivier Coulaud (INRIA Hiepacs), Nathalie Peyrard
  • Début de thèse : 1 octobre 2019
  • École doctorale : EDMI (Bordeaux)
  • Établissement :
  • Financement : bourse INRA-INRIA


Algorithmique des jeux pour la gestion en agro-écologie. 
Paul Jourdan

  • Résumé : Cette thèse vise à développer de nouvelles approches de la théorie des jeux algorithmiques, au croisement des jeux hypergraphiques et des jeux bayésiens, et plus généralement pour un ensemble de cadres de la famille des jeux complexes (jeux séquentiels, jeux stochastiques, Processus Décisionnels de Markov multi-agents). Ces nouvelles approches seront mises en œuvre pour aborder des problèmes d’agroécologie, autour de la conservation de la biodiversité et de la gestion des services écosystémiques. L'enjeu de cette thèse est l'étude des liens entre jeux à information incomplète, jeux hypergraphiques et jeux séquentiels, des points de vue théorique et algorithmique. Nous démontrerons l'intérêt pratique de ces avancées pour la gestion de la biodiversité et des services écosystémiques à l'échelle d'un territoire. A cet effet, nous mobiliserons des partenaires écologues avec lesquels des collaborations sont en cours, sur les liens entre décision séquentielle dans l'incertain et écologie.
  • Directeurs de thèse : Hélène Fargier (IRIT, CNRS-Université de Toulouse), Régis Sabbadin
  • Début de thèse : 1 octobre 2019
  • École doctorale : Mathématiques, Informatique et Télécoms, Toulouse (MITT°.
  • Établissement : UT3 - Université de Toulouse
  • Financement : 50 % INRAe + 50 % Région Occitanie


Améliorer les prévisions à court et moyen termes des modèles agronomiques en prenant mieux en compte l'incertitude des prévisions météorologiques. 
Ivana Aleksovska

  • Directeurs de thèse : Laure Raynaud (Météo-France), Robert Faivre
  • Co-directeur : François Brun (ACTA)
  • Début de thèse : 1 novembre 2017
  • École doctorale : Sciences de l'Univers, de l'Environnement et de l'Espace (Toulouse 3)
  • Établissement : UT3 - Université Toulouse 3 Paul Sabatier
  • Financement : 50 % #DigitAg + 50 % ACTA-Arvalis-IFV

La représentation compacte des jeux ordinaux.
Arij Azzabi

  • Directeurs de thèse : Nahla Ben Amor (ISG Tunis), Régis Sabbadin
  • Début de thèse : 1 novembre 2017
  • École doctorale : Informatique et Sciences de gestion
  • Établissement : Institut Supérieur de Gestion, Tunis.
  • Financement : ISG

Ils sont passés par l'unité

Thèses


Métamodélisation et optimisation robuste : application à la recherche d'idéotypes de plantes sous incertitude climatique.
Léonard Torossian

  • Directeurs de thèse : Aurélien Garivier (IMT) et Robert Faivre
  • Co-directeur : Victor Picheny
  • Soutenue le : 17 décembre 2019
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : UPS
  • Financement : 50% région Midi-Pyrénées, 50% INRA
  • Labellisation : #DigitAg

Conservation based on ecosystem complexity using network theory.
Hui Xiao

  • Directrice de thèse : Eve MacDonald-Madden (Univ. of Queensland)
  • Co-directeurs : Iadine Chadès (CSIRO) et Régis Sabbadin.
  • Thèse obtenue en : 2019
  • Ecole doctorale : School of Geography,  Planning and Environmental Management
  • Etablissement : University of Queensland
  • Financement : UQ

Optimisation en haute dimension pour l'aéodynamique interne et externe de véhicules.
David Gaudrie

  • Directeurs de thèse : Rodolphe Le Riche (LIMOS, Mines Saint Etienne)
  • Co-directeur : Victor Picheny
  • Soutenue le : 28 octobre 2019
  • Ecole doctorale : Saint Etienne
  • Etablissement : Mines Saint Etienne
  • Financement : CIFRE PSA
  • [[1]]

''Méthodes d'optimisation combinatoire en programmation mathématique. Application à la conception des systèmes de verger-maraîcher.
Sara Maqrot

  • Directeurs de thèse : Simon De Givry, Gauthier Quesnel et Marc Tchamitchian (UR Ecodéveloppement, INRAE Avignon)
  • Soutenue le : 23 septembre 2019
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : Université de toulouse
  • Financement : MITT
  • [Manuscrit]


Vers des agents cognitifs, affectifs et sociaux dans la simulation.
Mathieu Bourgais

  • Directeur de thèse : Laurent Vercouter
  • Co-directeur : Patrick Taillandier
  • Début de thèse : 1 octobre 2015
  • Soutenue le : 30 novembre 2018
  • Ecole doctorale : SPMII
  • Etablissement : INSA de Rouen
  • Financement : ANR ACTEUR
  • [Manuscrit]

Un modèle de Markov caché pour la dynamique des adventices dans un agrosystème.
Sebastian Le Coz

  • Directrice de thèse : Nathalie Peyrard
  • Co-directeur : Pierre-Olivier Cheptou (CEFE Montpellier)
  • Début de thèse : 1 novembre 2015
  • Soutenue le 12 mars 2019
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : UPS
  • Financement : 50% région Midi-Pyrénées, 50% projet Agrobiose
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance

Réseau bayésien dynamique étiqueté : cadre et apprentissage de structure pour application aux réseaux écologiques.
Etienne Auclair

  • Directeur de thèse : Régis Sabbadin
  • Co-directrice : Nathalie Peyrard
  • Début de thèse : 1 novembre 2015
  • Soutenue le : 24 janvier 2019
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : UPS
  • Financement : MITT
  • Manuscrit, transparents de la soutenance

Comprendre le processus de prise de décision opérationnelle en agriculture : une approche en rationalité limitée.
Charlotte Dayde

  • Directeur de thèse : Roger Martin-Clouaire
  • Co-directeur : Stéphane Couture
  • Début de thèse : 1 Décembre 2013
  • Soutenue le : 17 janvier 2017
  • Ecole doctorale : SEVAB
  • Etablissement : INPT
  • Financement : 50% MIA, 50% SAE2
  • [Manuscrit]

Résolution de processu décisionnels de Markov à espace d'état et d'action factorisés. Application en agroécologie.
Julia Radoszycki

  • Directrice de thèse : Nathalie Peyrard
  • Co-directeurs : Régis Sabbadin, Sabrina Gaba (UMR Agroécologie, INRA Dijon)
  • Début de thèse : Octobre 2012
  • Soutenue le : 9 octobre 2015
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : INSA
  • Financement : MITT
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance

Outiller l'adaptation des élevages fourragers au changement climatique: de l'analyse de la vulnérabilité à la conception participative de systèmes d'élevage.
Marion Sautier

  • Directeur de thèse : Roger Martin-Clouaire
  • Co-directeur : Michel Duru (UMR AGIR, INRA Toulouse)
  • Début de thèse : 1 Décembre 2010
  • Soutenue le : 12 Décembre 2013
  • Ecole doctorale : SEVAB
  • Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
  • Financement : 100% INRA (ASC)
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance

Approche modulaire pour la planification continue. Application à la conduite des systèmes de cultures.
Mahuna Akplogan

  • Directeur de thèse : Frédérick Garcia
  • Co-directeurs : Alexandre Joannon (INRA, SAD Rennes), Gauthier Quesnel
  • Soutenue le : 15 Mai 2013
  • Ecole doctorale : Mathématiques Informatique Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance

Développement d'une méthode adaptative d'échantillonnage spatialisé pour caractériser la composition du stock semencier des espèces adventices à l'échelle de la mosaïque paysagère.
Mathieu Bonneau

  • Directeur de thèse : Régis Sabbadin
  • Co-directrices : Sabrina Gaba (UMR BGA, INRA Dijon), Nathalie Peyrard
  • Soutenue le : 30 Novembre 2012
  • Ecole doctorale : Mathématiques Informatique Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance

Analyse des interactions dynamiques entre le développement de la plante hôte, l’architecture du couvert et le développement d’une épidémie de maladie fongique aérienne : cas du pathosystème pois/ascochytose.
Benjamin Richard

  • Directeur de thèse : Bernard Tivoli  (UMR BiO3P, INRA Rennes)
  • Co-directeur : Robert Faivre
  • Soutenue le : 19 Novembre 2012
  • Ecole doctorale : Vie Agro Santé (Agrocampus Ouest)
  • Manuscrit (français)

Les décisions d'assolement : une approche par modélisation et simulation a l'échelle de l'exploitation agricole.
Jérôme Dury

  • Directeur de thèse : Jacques-Eric Bergez (UMR AGIR, INRA Toulouse)
  • Co-directeurs : Arnaud Reynaud (LERNA, INRA Toulouse), Frédérick Garcia
  • Soutenue le : 9 Décembre 2011
  • Ecole doctorale : Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques Bioingénieries (Toulouse III)
  • Manuscrit (anglais)

Analyse et conception de systèmes fourragers flexibles par modélisation systémique et simulation dynamique.
Guillaume Martin

  • Directeur de thèse : Roger Martin-Clouaire
  • Co-directeur : Michel Duru (UMR AGIR, INRA Toulouse)
  • Soutenue le : 9 Novembre 2009
  • Ecole doctorale : Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques Bioingénieries (Toulouse III)
  • Mots-clés : système fourrager, modélisation, simulation, diversité, flexibilité, comportement gestionnaire
  • Manuscrit (français)

 

Post-doctorats

Multi-objective optimization applied to the management of landscapes provisioning several ecosystem services.
Yann Dujardin

  • Responsables: Nathalie Peyrard et  Régis Sabbadin
  • Période : 09/17 à 02/19
  • Laboratoires : Collaboration entre INRA-MIAT et INRA-DYNAFOR

Design of mathematics and artificial intelligence tools for the mapping and sustainable management of crops pests using autonomous UAVs.
Alexandre Albore

  • Responsables: Nathalie Peyrard,  Régis Sabbadin et Florent Teichtel
  • Période : 11/13 à 11/15
  • Laboratoires : Collaboration entre MIAT et ONERA-DCSD
    Echantillonnage et cartographie d'adventices, mise en oeuvre sur drônes autonomes.

Optimal management of food-webs.
Will Probert

  • Période(s) : 6 mois en 2012, 3 mois en 2013
  • Laboratoires : Collaboration entre MIAT et CSIRO/Univ. of Queensland

Control of competitive contact processes on graphs : application to the control of interacting invasive species on a network of sites.
Alana Moore

  • Période : 5 mois en 2010.
  • Laboratoires : Collaboration entre MIAT et University of Melbourne, Australian Centre of Excellence for Risk Analysis.

 

 

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