Logiciels MAD : Différence entre versions

De MIAT INRA
Aller à : navigation, rechercher
Ligne 8 : Ligne 8 :
 
VLE
 
VLE
  
[[File:VLE.png|thumb|center|100px|VLE.png]]
+
[[File:VLE.png|thumb|center|200px|VLE.png]]
  
 
| [http://vle-project.org VLE (Virtual Laboratory Environment)] est une plate-forme de modélisation et de simulation de systèmes complexes. Il permet l'utilisation de différents formalismes pour la spécification de modèles et leurs simulations. VLE est basée sur la théorie de la modélisation et de la simulation initiée par B.P. Zeigler dans les années 70 et enrichie par une communauté internationale active. VLE propose en ensemble de [http://www.github.com/vle-forge bibliothèques dynamiques] libre et réutilisable en C++ et des programmes tel qu'un simulateur, une interface graphique de modélisation, des paquets R et python, ainsi qu'un de gestion de plan d'expérience sur cluster de calculs.
 
| [http://vle-project.org VLE (Virtual Laboratory Environment)] est une plate-forme de modélisation et de simulation de systèmes complexes. Il permet l'utilisation de différents formalismes pour la spécification de modèles et leurs simulations. VLE est basée sur la théorie de la modélisation et de la simulation initiée par B.P. Zeigler dans les années 70 et enrichie par une communauté internationale active. VLE propose en ensemble de [http://www.github.com/vle-forge bibliothèques dynamiques] libre et réutilisable en C++ et des programmes tel qu'un simulateur, une interface graphique de modélisation, des paquets R et python, ainsi qu'un de gestion de plan d'expérience sur cluster de calculs.
Ligne 24 : Ligne 24 :
 
MDPtoolbox
 
MDPtoolbox
  
[[File:MDPtoolbox.png|thumb|center|70px|MDPtoolbox.png]]
+
[[File:MDPtoolbox.png|thumb|center|150px|MDPtoolbox.png]]
  
 
| [http://www.inra.fr/mia/T/MDPtoolbox MDPtoolbox] propose un ensemble de fonctions relatives à la résolution de Processus Décisionnels de Markov (Markov Decision Processes en anglais). La toolbox est disponible dans les environnements [http://fr.mathworks.com/products/matlab/ MATLAB], [http://www.gnu.org/software/octave/ GNU Octave], [http://www.scilab.org/ Scilab] and [http://www.r-project.org/ R].<br/>
 
| [http://www.inra.fr/mia/T/MDPtoolbox MDPtoolbox] propose un ensemble de fonctions relatives à la résolution de Processus Décisionnels de Markov (Markov Decision Processes en anglais). La toolbox est disponible dans les environnements [http://fr.mathworks.com/products/matlab/ MATLAB], [http://www.gnu.org/software/octave/ GNU Octave], [http://www.scilab.org/ Scilab] and [http://www.r-project.org/ R].<br/>
Ligne 31 : Ligne 31 :
 
GMDPtoolbox
 
GMDPtoolbox
  
[[File:GMDPtoolbox.png|thumb|center|70px|GMDPtoolbox.png]]
+
[[File:GMDPtoolbox.png|thumb|center|100px|GMDPtoolbox.png]]
  
 
| [http://www.inra.fr/mia/T/GMDPtoolbox GMDPtoolbox] propose un ensemble de fonctions relatives à la résolution de Processus Décisionnels de Markov sur Graphe (Graph-based Markov Decision Processes en anglais). La toolbox est actuellement disponible dans l'environnement [http://fr.mathworks.com/products/matlab/ MATLAB].<br/>
 
| [http://www.inra.fr/mia/T/GMDPtoolbox GMDPtoolbox] propose un ensemble de fonctions relatives à la résolution de Processus Décisionnels de Markov sur Graphe (Graph-based Markov Decision Processes en anglais). La toolbox est actuellement disponible dans l'environnement [http://fr.mathworks.com/products/matlab/ MATLAB].<br/>
Ligne 38 : Ligne 38 :
 
Packages R
 
Packages R
  
[[File:Rlogo.jpeg|thumb|center|70px|Rlogo.jpeg]]
+
[[File:Rlogo.jpeg|thumb|center|200px|Rlogo.jpeg]]
  
 
| [https://cran.r-project.org/web/packages/DiceOptim/index.html DiceOptim] propose un ensemble de fonctions pour l'optimisation bayésienne dans les cas simples, bruités ou avec contraintes.
 
| [https://cran.r-project.org/web/packages/DiceOptim/index.html DiceOptim] propose un ensemble de fonctions pour l'optimisation bayésienne dans les cas simples, bruités ou avec contraintes.
Ligne 53 : Ligne 53 :
 
GMtoolbox
 
GMtoolbox
  
[[File:GMtoolbox.png|thumb|center|70px|GMtoolbox.png]]
+
[[File:GMtoolbox.png|thumb|center|150px|GMtoolbox.png]]
  
 
| [http://www.inra.fr/mia/T/GMtoolbox GMtoolbox] propose un ensemble de fonctions permettant de représenter un modèle graphique sous forme de graphe de facteurs (factor graph) et d'inférer des marginales possiblement avec observations. La toolbox est actuellement disponible dans l'environnement [http://fr.mathworks.com/products/matlab/ MATLAB].<br/>
 
| [http://www.inra.fr/mia/T/GMtoolbox GMtoolbox] propose un ensemble de fonctions permettant de représenter un modèle graphique sous forme de graphe de facteurs (factor graph) et d'inférer des marginales possiblement avec observations. La toolbox est actuellement disponible dans l'environnement [http://fr.mathworks.com/products/matlab/ MATLAB].<br/>
 
|}
 
|}

Version du 14 juin 2019 à 13:58

Logiciels auxquels l'équipe a participé.


VLE

VLE.png
VLE (Virtual Laboratory Environment) est une plate-forme de modélisation et de simulation de systèmes complexes. Il permet l'utilisation de différents formalismes pour la spécification de modèles et leurs simulations. VLE est basée sur la théorie de la modélisation et de la simulation initiée par B.P. Zeigler dans les années 70 et enrichie par une communauté internationale active. VLE propose en ensemble de bibliothèques dynamiques libre et réutilisable en C++ et des programmes tel qu'un simulateur, une interface graphique de modélisation, des paquets R et python, ainsi qu'un de gestion de plan d'expérience sur cluster de calculs.

GAMA

Multiple application domains.png


GAMA est une plate-forme générique open-source destinée à la conception et à la simulation de base d'agents. Elle permet de construire à l’aide d’un langage de modélisation simple d’accès, le GAML, le contenu d’un modèle. Elle connaît depuis quelques année un essor important grâce à sa capacité à construire et simuler des modèle à large échelle, comprenant des centaines de milliers d’agents et des données géographiques détaillées. Elle dispose également d’outils de visualisation 3D avancés ainsi que d’outils dédiés à la construction de jeux sérieux.

MDPtoolbox

MDPtoolbox.png
MDPtoolbox propose un ensemble de fonctions relatives à la résolution de Processus Décisionnels de Markov (Markov Decision Processes en anglais). La toolbox est disponible dans les environnements MATLAB, GNU Octave, Scilab and R.

GMDPtoolbox

GMDPtoolbox.png
GMDPtoolbox propose un ensemble de fonctions relatives à la résolution de Processus Décisionnels de Markov sur Graphe (Graph-based Markov Decision Processes en anglais). La toolbox est actuellement disponible dans l'environnement MATLAB.

Packages R

Rlogo.jpeg
DiceOptim propose un ensemble de fonctions pour l'optimisation bayésienne dans les cas simples, bruités ou avec contraintes.

GPareto est un paquet dédié à l'optimisation multi-objectifs à l'aide de processus gaussiens.

GPGame est un paquet dédié à la recherche d'équilibre de jeux (Nash, etc.) par optimisation bayésienne.

SISIR est un paquet dédié à la réduction de dimension dans des espaces fonctionnels.

GADAG est un paquet dédié à l'apprentissage de graphes acycliques dirigés (DAG) creux.

GMtoolbox

GMtoolbox.png
GMtoolbox propose un ensemble de fonctions permettant de représenter un modèle graphique sous forme de graphe de facteurs (factor graph) et d'inférer des marginales possiblement avec observations. La toolbox est actuellement disponible dans l'environnement MATLAB.
Génotoul BioInfo
Équipe RECORD
IMABS
Outils personnels