Développement d'approches d'apprentissage par renforcement dans les jeux stochastiques pour la coordination en temps réel d'agents de planification autonomes - Application aux jeux de conservation
  • Directeurs de thèse : Régis Sabbadin (INRAE, MIAT), Meritxell Vinyals (INRAE, MIAT)
  • Début de thèse : 1er Novembre 2023
  • École doctorale : MITT
  • Établissement : Université de Toulouse III Paul Sabatier
  • Financement : 100% Financement ANR, Projet CHIP-GT
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Prasanna Maddila
Doctorant, Intelligence Artificielle
Intégration de données multi-omiques appariées à grande échelle
  • Directrices de thèse : Nathalie Vialaneix (INRAE, MIAT), Andrea Rau (INRAE, GABI)
  • Début de thèse : 1er octobre 2023
  • École doctorale : MITT
  • Établissement : INSA Toulouse
  • Financement : 100% PEPR Agroécologie et numérique - AgroDiv
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kojeonghwan
Jeong Hwan Ko
Doctorant, statistique
Intégration de données multi-omiques de la peau issues d'expériences multi-groupes
  • Directrices de thèse : Céline Brouard et Nathalie Vialaneix
  • Début de thèse : 1er octobre 2022
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : Université Toulouse III
  • Financement : Pierre Fabre Dermo-Cosmétique (CIFRE)
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mercadieraurelie
Aurélie Mercadié
Doctorante, informatique, statistique
Apprentissage par renforcement à base de modèles pour le contrôle de processus de décision semi-markoviens déterministes par morceaux, partiellement observables.
  • Directeurs de thèse : Benoîte de Saporta (IMAG, Montpellier), Alice Cleynen (IMAG-CNRS, Montpellier), Régis Sabbadin (INRAE, MIAT)
  • Début de thèse : 1 septembre 2022
  • Établissement : Université de Montpellier
  • Financement : 100% ANR HSMM-INCA
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Orlane Rossini
Nouveaux modèles de Semi-Markov caché multi-chaînes pour les dynamiques de métapopulation avec population partiellement observable.
  • Directeurs de thèse : Nathalie Peyrard (INRAE, MIAT), Nikolaos Limnios (UTC) , Pierre-Olivier Cheptou (CEFE)
  • Début de thèse : 1 octobre 2021
  • École doctorale : MITT
  • Établissement : Université Paul Sabatier
  • Financement : 50% ANR, 50% département MathNum
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bacavehanna
Hanna Bacave
Doctorante, statistique
Apprentissage de Modèles Graphiques pour le design de protéines
  • Directeurs de thèse : Sophie Barbe (INRAE.INSA Toulouse), Thomas Schiex
  • Début de thèse : Octobre 2020
  • Ecole doctorale : SEVAB
  • Etablissement : INRAE/INSA
  • Financement : 100% EUR BIOECO
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defresnemarianne
Marianne Defresne
Doctorante, informatique
Apprentissage Pseudo-Booléen pour le raisonnement sur Modèles Graphiques
  • Directeurs de thèse : George Katsirelos (MIA Paris, INRAE), Simon de Givry
  • Début de thèse : Octobre 2020
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : INRAE
  • Financement : 100% ANITI - UPS
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montalbanopierre
Pierre Montalbano
Doctorant, mathématiques appliquées, informatique
Minorants convexes pour le raisonnement sur Modèles Graphiques
  • Directeurs de thèse : George Katsirelos (MIA Paris, INRAE), Thomas Schiex
  • Début de thèse : Octobre 2020
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : INRAE
  • Financement : 100% ANITI - UPS
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durantevalentin
Valentin Durante
Doctorant, mathématiques appliquées, informatique
Utilisation de la simulation à base d’agents et de la théorie de l’argumentation pour mieux appréhender la diffusion et l'appropriation des outils numériques en agriculture.
  • Directeurs de thèse : Patrick Taillandier (INRAE, MIAT), Rallou Thomopoulos (INRAE, IATE), Stéphane Couture (INRAE, MIAT)
  • Début de thèse : 1 novembre 2020
  • École doctorale : MITT
  • Établissement : UT3 - Université de Toulouse
  • Financement : 50% #Digitag, 50% département MathNum
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sadouloic
Loic Sadou
Doctorant, informatique
Comprendre et contrôler les phénomènes de priming des plantes par stimulation acoustique pour la résistance aux stress biotiques.
  • Directeurs de thèse : Frédérick Garcia, Adelin Barbacci (LIPM)
  • Début de thèse : 1 novembre 2019
  • École doctorale : Mathématiques, Informatique et Télécoms, Toulouse (MITT).
  • Établissement : UT3 - Université de Toulouse
  • Financement : 50 % INRAe + 50 % Région Occitanie
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hadjamorkhaoula
Khaoula Hadj Amor
Doctorante, mathématique appliquées, informatique

Thèses et postdocs terminés

Apprentissage statistique pour l'identification d'OTUs et la caractérisation de la biodiversité.
  • Directeurs de thèse : Alain Franc (INRA BioGeCo), Olivier Coulaud (INRIA Hiepacs), Nathalie Peyrard
  • Soutenane : 2 février 2023
  • École doctorale : EDMI (Bordeaux)
  • Financement : bourse INRA-INRIA
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Anwar Abouabdallah
Doctorant, statistique
Identification, développement et test d'indicateurs de la vulnérabilité au changement climatique de systèmes de culture maïsicoles intégrant des pratiques agroécologiques.
  • Directeurs de thèse : Magali Willaume (INRAE AGIR), Jacques-Eric Bergez (INRAE, AGIR), Stéphane Couture
  • Soutenance : 9 février 2023
  • École doctorale : SEVAB
  • Financement : bourse ACCAF-Région
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Marine Albert
Algorithmique des jeux pour la gestion en agro-écologie.
  • Directeurs de thèse : Hélène Fargier (IRIT, CNRS-Université de Toulouse), Régis Sabbadin
  • Soutenance : 24 novembre 2022
  • École doctorale : Mathématiques, Informatique et Télécoms, Toulouse (MITT°.
  • Établissement : UT3 - Université de Toulouse
  • Financement : 50 % INRAe + 50 % Région Occitanie
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Paul Jourdan
Exact Methods for Bayesian Network Structure Learning
  • Directreurs de thèse : George Katsirelos (MIA Paris), Simon De Givry
  • Soutenue le : 31/03/2022
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : INRAE
  • Financement : ANR DemoGraph
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Fulya Ural
Design de protéines multi-états et thermostabilisation
  • Directeurs de thèse : Thomas Schiex & Sophie Barbe (LISBP)
  • Soutenue le : 05/03/2021
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : INRA
  • Financement : INRA & Région
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Jelena Vucinic
Design de protéines et réseaux de fonctions de coûts
  • Directeurs de thèse : Thomas Schiex & Sophie Barbe (LISBP)
  • Soutenue le : 01/03/2021
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : UPS
  • Financement : ENS Rennes
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Manon Ruffini
Intégration de données métabolomiques par quantification de données haut débit et application à l’analyse des causes de la mortalité périnatale chez le porc
  • Directrices de thèse : Nathalie Vialaneix (MIAT, INRA), Rémi Servien (InTheRese, INRA), Laurence Liaubet (GenPhySE, INRA), Hélène Quesnel (PEGASE, INRA)
  • Soutenue le : 02/07/2021
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : Université Toulouse Capitole (Toulouse I)
  • Financement : 50% départements MIA/GA/SA - 50% #DigitAg
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Gaëlle Lefort
Analyse de données RNAseq pour la narcolepsie
  • Directeurs de thèse : Matthias Zytnicki et Roland Liblau (INSERM)
  • Soutenue le : 18/10/2021
  • Ecole doctorale : BSB
  • Etablissement : INSERM
  • Financement : BSB
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Leida Khajavi-Ettouati
La représentation compacte des jeux ordinaux.
  • Directeurs de thèse : Nahla Ben Amor (ISG Tunis), Régis Sabbadin
  • Soutenance : 10 juin 2021
  • École doctorale : Informatique et Sciences de gestion
  • Établissement : Institut Supérieur de Gestion, Tunis.
  • Financement : ISG
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Arij Azzabi
Classification hiérarchique sous contrainte de contiguïté pour l’analyse de données Hi-C
  • Directrices de thèse : Nathalie Vialaneix (MIAT, INRA), Marie Chavent (IMB & Inria), Pierre Neuvial (IMT & CNRS) et Sylvain Foissac (GenPhySE, INRA)
  • Soutenue le : 27/10/2021
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : Université Toulouse III (Paul Sabatier)
  • Financement : 100% département INRAE/MIA (appel INRA/Inria)
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Nathanael Randriamihamison
Reconstruction de réseaux de régulation de résistance pour un couple plante/pathogène, par des méthodes de statistiques et d'intelligence artificielle.
  • Encadrants : Sylvain Raffaele (LIPM) et Frédérick Garcia.
  • Début de PostDocs : Avril 2020 (12 mois).
  • Financements : ANR, projet PROBITY.
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Lise Pomies
Postdoc, modélisation
Améliorer les prévisions à court et moyen termes des modèles agronomiques en prenant mieux en compte l'incertitude des prévisions météorologiques.
  • Directeurs de thèse : Laure Raynaud (Météo-France), Robert Faivre
  • Co-directeur : François Brun (ACTA)
  • Soutenance : 8 décembre 2020
  • École doctorale : Sciences de l’Univers, de l’Environnement et de l’Espace (Toulouse 3)
  • Établissement : UT3 - Université Toulouse 3 Paul Sabatier
  • Financement : 50 % #DigitAg + 50 % ACTA-Arvalis-IFV
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Ivana Aleksovska
Optimisation en haute dimension pour l'aéodynamique interne et externe de véhicules.
  • Directeurs de thèse : Rodolphe Le Riche (LIMOS, Mines Saint Etienne)
  • Co-directeur : Victor Picheny
  • Soutenue le : 28 octobre 2019
  • Ecole doctorale : Saint Etienne
  • Etablissement : Mines Saint Etienne
  • Financement : CIFRE PSA
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David Gaudrie
Conservation based on ecosystem complexity using network theory.
  • Directrice de thèse : Eve MacDonald-Madden (Univ. of Queensland)
  • Co-directeurs : Iadine Chadès (CSIRO) et Régis Sabbadin.
  • Thèse obtenue en : 2019
  • Ecole doctorale : School of Geography, Planning and Environmental Management
  • Etablissement : University of Queensland
  • Financement : UQ
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Hui Xiao
Métamodélisation et optimisation robuste : application à la recherche d'idéotypes de plantes sous incertitude climatique.
  • Directeurs de thèse : Aurélien Garivier (IMT) et Robert Faivre
  • Co-directeur : Victor Picheny
  • Soutenue le : 17 décembre 2019
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : UPS
  • Financement : 50% région Midi-Pyrénées, 50% INRA
  • Labellisation : #DigitAg
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Léonard Torossian
Méthodes approchées d'optimisation combinatoire en programmation mathématique. Application à la conception de vergers maraîchers
  • Directeurs de thèse : Gauthier Quesnel, Simon de Givry et Marc Tchamitchian
  • Soutenue le : 23/09/2019
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
  • Financement : MITT
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Sara Maqrot
Analyse de la dynamique évolutive de petits ARNs non-codants bactériens : mise au point d'une stratégie et application aux firmicutes
  • Directrices de thèse : Hélène Chiapello et Christine Gaspin
  • Soutenue le : 5/01/2018
  • Ecole doctorale : SEVAB
  • Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
  • Financement : 50% Inra - 50% région
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Franck Cerutti
Intégration de données hétérogènes complexes à partir de tableaux de tailles déséquilibrées
  • Directrices de thèse : Nathalie Vialaneix (MIAT, INRA) et Nathalie Viguerie (I2MC, INSERM)
  • Soutenue le : 19/10/2018
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : Université Toulouse Capitole (Toulouse I)
  • Financement : 50% Methodomics - 50% région
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Alyssa Imbert
Vers des agents cognitifs, affectifs et sociaux dans la simulation.
  • Directeur de thèse : Laurent Vercouter
  • Co-directeur : Patrick Taillandier
  • Soutenue le : 30 novembre 2018
  • Ecole doctorale : SPMII
  • Etablissement : INSA de Rouen
  • Financement : ANR ACTEUR
  • [Manuscrit]
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Mathieu Bourgais
Apprentissage statistique pour l’intégration de données de sources et de natures multiples
  • Directrice de thèse : Nathalie Villa-Vialaneix (MIAT, INRA)
  • Soutenue le : 15/12/2017
  • Ecole doctorale : SEVAB
  • Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
  • Financement : salarié (Ingénieur d’Études MIA-T)
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Jérôme Mariette
Algorithm optimization for protein design
  • Directeur de thèse : Thomas Schiex
  • Co-directeur : Sophie Barbe
  • Soutenue le : 18/12/2017
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : INRA
  • Financement : 50%INRA 50%Region
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Clément Viricel
Sélection de facteurs de transcription liés à la sécheresse pour le tournesol (SUNRISE)
  • Responsables : Simon de Givry et Brigitte Mangin
  • Période : 05/2017 à 07/2017
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Clément CARRE
Comprendre le processus de prise de décision opérationnelle en agriculture : une approche en rationalité limitée.
  • Directeur de thèse : Roger Martin-Clouaire
  • Co-directeur : Stéphane Couture
  • Soutenue le : 17 janvier 2017
  • Ecole doctorale : SEVAB
  • Etablissement : INPT
  • Financement : 50% MIA, 50% SAE2
  • [Manuscrit]
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Charlotte Dayde
Multi-objective optimization applied to the management of landscapes provisioning several ecosystem services.
  • Responsables: Nathalie Peyrard et Régis Sabbadin
  • Période : 09/17 à 02/19
  • Laboratoires : Collaboration entre INRA-MIAT et INRA-DYNAFOR
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Yann Dujardin
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Lise Pomiès
Biologie intégrative des réponses au stress et robustesse chez le porc
  • Directeur de thèse : Pierre Mormède (GenPhySE, INRA)
  • Co-directrices : Elena Terenina (GenPhySE, INRA) & Nathalie Villa-Vialaneix (MIAT, INRA)
  • Soutenue le : 27/10/2016
  • Ecole doctorale : SEVAB
  • Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
  • Financement : ANR (projet SusOStress) & Région Midi-Pyrénées
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Valérie SAUTRON
Optimisation et design d'enzymes
  • Responsables : Sophie Barbe (LISBP), Thomas Schiex
  • Période : 09/2016 à 12/2017
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David SIMONCINI
Understanding the Human-Restricted Host Tropism of Typhoidal Salmonella (Sal Host Trop)
  • Responsables : Héléne Chiapello et Thomas Schiex
  • Période : 06/2016 à 11/2017
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Ludovic MALLET
Résolution de processu décisionnels de Markov à espace d'état et d'action factorisés. Application en agroécologie.
  • Directrice de thèse : Nathalie Peyrard
  • Co-directeurs : Régis Sabbadin, Sabrina Gaba (UMR Agroécologie, INRA Dijon)
  • Soutenue le : 9 octobre 2015
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : INSA
  • Financement : MITT
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance
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Julia Radoszycki
Réseau bayésien dynamique étiqueté : cadre et apprentissage de structure pour application aux réseaux écologiques.
  • Directeur de thèse : Régis Sabbadin
  • Co-directrice : Nathalie Peyrard
  • Début de thèse : 1 novembre 2015
  • Soutenue le : 24 janvier 2019
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : UPS
  • Financement : MITT
  • Manuscrit, transparents de la soutenance
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Etienne Auclair
Filtrage dans les réseaux de contraintes pondérées
  • Directeur de thèse : Thomas Schiex
  • Soutenue le : 15/01/2015
  • Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse
  • Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
  • Financement : Contrat ANR
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Thi Hong Hiep NGUYEN
Un modèle de Markov caché pour la dynamique des adventices dans un agrosystème.
  • Directrice de thèse : Nathalie Peyrard
  • Co-directeur : Pierre-Olivier Cheptou (CEFE Montpellier)
  • Début de thèse : 1 novembre 2015
  • Soutenue le 12 mars 2019
  • Ecole doctorale : MITT
  • Etablissement : UPS
  • Financement : 50% région Midi-Pyrénées, 50% projet Agrobiose
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance
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Sebastian Le Coz
Recherche de facteurs génétiques impliqués dans l'élaboration du rendement sous contrainte hydrique chez le tournesol Helianthus annuus par génétique d'association et analyse de liaison dans une population recombinante
  • Soutenue le : 14/02/2014
  • Directrice de thèse : Brigitte Mangin
  • Co-directeur : Patrick Vincourt (Laboratoire des Interactions Plantes Microorganismes, INRA Toulouse)
  • Ecole doctorale : Sciences Ecologiques,Vétérinaires, Agronomiques, Bioingénieries (Toulouse III)
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Elena CADIC
Contribution à la modélisation et l'inférence de réseau de régulation de gènes
  • Directeur de thèse : Sébastien Gadat (Institut Mathématique de Toulouse)
  • Co-directeurs : Christine Cierco-Ayrolles et Matthieu Vignes
  • Soutenue le : 05/12/2014
  • Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse
  • Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
  • Financement : MENRT
  • Mots-clés : Statistiques, grande dimension, régression, parcimonie, optimisation.
  • Manuscrit : Manuscrit (français), Soutenance
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Magali CHAMPION
Approche modulaire pour la planification continue. Application à la conduite des systèmes de cultures.
  • Directeur de thèse : Frédérick Garcia
  • Co-directeurs : Alexandre Joannon (INRA, SAD Rennes), Gauthier Quesnel
  • Soutenue le : 15 Mai 2013
  • Ecole doctorale : Mathématiques Informatique Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance
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Mahuna Akplogan
Optimisation et design d'enzymes
  • Responsable : Thomas Schiex
  • Période : 04/2013 à 08/2013
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Jessica DAVIES
Outiller l'adaptation des élevages fourragers au changement climatique: de l'analyse de la vulnérabilité à la conception participative de systèmes d'élevage.
  • Directeur de thèse : Roger Martin-Clouaire
  • Co-directeur : Michel Duru (UMR AGIR, INRA Toulouse)
  • Soutenue le : 12 Décembre 2013
  • Ecole doctorale : SEVAB
  • Etablissement : Université Paul Sabatier (Toulouse III)
  • Financement : 100% INRA (ASC)
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance
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Marion Sautier
Optimal management of food-webs.
  • Période(s) : 6 mois en 2012, 3 mois en 2013
  • Laboratoires : Collaboration entre MIAT et CSIRO/Univ. of Queensland
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Will Probert
Analyse des bases génétiques et moléculaires de la tolérance à la sécheresse chez le maïs par génétique d'association
  • Soutenue le : 06/01/2012
  • Directrice de thèse : Brigitte Mangin
  • Co-directeur : Pierre Dubreuil (Biogemma, Génétique et Génomique des Céréales)
  • Ecole doctorale : Sciences Ecologiques,Vétérinaires, Agronomiques, Bioingénieries (Toulouse III)
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Sofiane MEZMOUK
Analyse des interactions dynamiques entre le développement de la plante hôte, l’architecture du couvert et le développement d’une épidémie de maladie fongique aérienne : cas du pathosystème pois/ascochytose.
  • Directeur de thèse : Bernard Tivoli (UMR BiO3P, INRA Rennes)
  • Co-directeur : Robert Faivre
  • Soutenue le : 19 Novembre 2012
  • Ecole doctorale : Vie Agro Santé (Agrocampus Ouest)
  • Manuscrit (français)
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Benjamin Richard
Apprentissage de la structure de réseaux bayésiens. Application aux données de génétique-génomique
  • Soutenue le : 07/12/2012
  • Directrice de thèse : Brigitte Mangin
  • Co-directeur : Simon de Givry
  • Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
  • Mots-clés : modèle graphique probabiliste, réseau bayésien, optimisation sous contraintes, recherche stochastique gloutonne, apprentissage, génétique génomique, réseau de régulation de gènes
  • Manuscrit : Manuscrit (français), soutenance
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Jimmy VANDEL
Développement d'une méthode adaptative d'échantillonnage spatialisé pour caractériser la composition du stock semencier des espèces adventices à l'échelle de la mosaïque paysagère.
  • Directeur de thèse : Régis Sabbadin
  • Co-directrices : Sabrina Gaba (UMR BGA, INRA Dijon), Nathalie Peyrard
  • Soutenue le : 30 Novembre 2012
  • Ecole doctorale : Mathématiques Informatique Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
  • Manuscrit (français), transparents de la soutenance
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Mathieu Bonneau
Identification et caractérisation de nouveaux ARN non codant chez l'archée hyperthermophile Pyrococcus abyssi
  • Soutenue le :18/03/2011
  • Directrice de thèse : Béatrice Clouet-d’Orval (Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaire, Université Toulouse III)
  • Co-directrice : Christine Gaspin
  • Co-encadrante : Annick Moisan
  • Ecole doctorale : Biologie - Santé - Biotechnologies (Toulouse III)
  • Mots-clés : ARN non codant, Pyrococcus abyssi, Thermococcales, Bio-informatique, Complexes ribonucléoprotéiques
  • Manuscrit : Manuscrit (français)
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Kounthéa PHOK
Détection des duplications en tandem au niveau nucléique à l'aide de la théorie des flots
  • Soutenue le : 28/11/2011
  • Directeur de thèse : Thomas Schiex
  • Co-directeur : Thomas Faraut (Laboratoire de Génétique Cellulaire, INRA Toulouse)
  • Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
  • Mots clés : Duplication, Tandem, Annotation, Graphe, Flot, ADN, Evolution
  • Manuscrit : Manuscrit (français)
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Eric AUDEMARD
Décompositions fonctionnelles et structurelles dans les modèles graphiques probabilistes appliquées à la reconstruction d’haplotypes
  • Soutenue le : 12/12/2011
  • Directeur de thèse : Simon de Givry
  • Co-directeur : Andres Legarra (Station d’Amélioration Génétique des Animaux, INRA Toulouse)
  • Ecole doctorale : Mathématiques Informatique et Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
  • Mots-clés : optimisation combinatoire, modèle graphique probabiliste, réseau de fonctions de coûts, reconstruction d’haplotypes, pedigree
  • Manuscrit : Manuscrit (français)
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Aurélie FAVIER
Les décisions d'assolement : une approche par modélisation et simulation a l'échelle de l'exploitation agricole.
  • Directeur de thèse : Jacques-Eric Bergez (UMR AGIR, INRA Toulouse)
  • Co-directeurs : Arnaud Reynaud (LERNA, INRA Toulouse), Frédérick Garcia
  • Soutenue le : 9 Décembre 2011
  • Ecole doctorale : Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques Bioingénieries (Toulouse III)
  • Manuscrit (anglais)
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Jérôme Dury
Control of competitive contact processes on graphs : application to the control of interacting invasive species on a network of sites.
  • Période : 5 mois en 2010.
  • Laboratoires : Collaboration entre MIAT et University of Melbourne, Australian Centre of Excellence for Risk Analysis.
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Alana Moore
Analyse et conception de systèmes fourragers flexibles par modélisation systémique et simulation dynamique.
  • Directeur de thèse : Roger Martin-Clouaire
  • Co-directeur : Michel Duru (UMR AGIR, INRA Toulouse)
  • Soutenue le : 9 Novembre 2009
  • Ecole doctorale : Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques Bioingénieries (Toulouse III)
  • Mots-clés : système fourrager, modélisation, simulation, diversité, flexibilité, comportement gestionnaire
  • Manuscrit (français)
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Guillaume Martin
Prédiction de gènes d'ARN dans les séquences génomiques
  • Soutenue le : 15/06/2009
  • Directeur de thèse : Christine Gaspin
  • Co-directeurs : Christine Cierco-Ayrolles et Christian Boucher (Laboratoire des Interactions plantes-microorganismes, INRA, Toulouse)
  • Ecole doctorale : Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques, Bioingénieries (Toulouse III)
  • Mots-clés : Noncoding RNA detection, Generalised Liner Models, Staphylococcus aureus, HMM, Ralstonia solanacearum, Viterbi training, Compositional bias
  • Manuscrit : Manuscrit (français)
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Ana KOZOMARA
Recherche d'ARN non-codants par réseaux de contraintes pondérées
  • Soutenue le : 12/12/2007
  • Directeurs de thèse : Christine Gaspin et Thomas Schiex
  • Ecole doctorale : Mathématiques, Informatique et Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
  • Manuscrit : Manuscrit (français)
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Matthias ZYTNICKI
Un cadre algébrique général pour représenter et résoudre des problèmes de décision séquentielle avec incertitudes, faisabilités et utilités
  • Soutenue le : 17/11/2006 - Prix national de thèse ASTI 2007 (ANR)..
  • Directeurs de thèse : Thomas Schiex, Gérard Verfaillie (ONERA, Toulouse)
  • Ecole doctorale : École Nationale Supérieure de l’Aéronautique et de l’Espace
  • Manuscrit : Manuscrit (Version courte en français)
  • Manuscript : Manuscrit (Version longue en anglais)
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Cédric PRALET
Cartographie de gènes à caractères quantitatifs par déséquilibre de liaison
  • Soutenue le : 12/12/2006
  • Directeurs de thèse : Brigitte Mangin, Jean-Marc Azaïs (Institut Mathématique de Toulouse, Toulouse III) et Hubert de Rochambeau (Station d’Amélioration Génétique des Animaux, INRA, Toulouse)
  • Ecole doctorale : Mathématiques, Informatique et Télécommunications de Toulouse (Toulouse III)
  • Manuscrit : Manuscrit (français)
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Simon BOITARD
Stratégies et algorithmes pour la décomposition et la résolution de problèmes d’optimisation sous contraintes
  • Responsables : Thomas Schiex & Simon de Givry
  • Période : 01/07/2006 au 31/05/2008
  • Contrat ANR Blanc STALDECOPT
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Marti SANCHEZ
Design of mathematics and artificial intelligence tools for the mapping and sustainable management of crops pests using autonomous UAVs.
  • Responsables: Nathalie Peyrard, Régis Sabbadin et Florent Teichtel
  • Période : 11/13 à 11/15
  • Laboratoires : Collaboration entre MIAT et ONERA-DCSD
  • Echantillonnage et cartographie d’adventices, mise en oeuvre sur drônes autonomes.
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Alexandre Albore