Présentation de la nouvelle infrastructure de calcul de la plateforme GenoToul Bioinfo (5000 cœurs, 80TB de RAM, 4*GPU, +2PiB stockage parallèle)

Didier Laborie (séminaire interne plateforme bio-info)


Date
10 mars 2023

Résumé : La plateforme Bioinfo GenoToul vient de faire l’acquisition d’une nouvelle infrastructure de calcul pour remplacer ses équipements vieillissants.

Il s’agit d’un cluster de calcul fonctionnant à travers SLURM (Simple Linux Utility for Resource Management) composé de :

  • 1 serveur d’administration (provisionnement, monitoring, authentification, ordonnancement des jobs)
  • 2 serveurs de login (accès depuis l’extérieur, transferts, dev, compilation, test et soumission sur le cluster de calcul)
  • 1 serveur de visualisation (bureau à distance, rendu 3D)
  • 1 serveur GP/GPU : pour faire de l’IA
  • 39 nœuds de calcul à forte mémoire RAM (2TB)
  • +2PiB de stockage parallèle (dont 223TiB rapide)
  • Réseau d’interconnexion Infiniband HDR à 100Gbs